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solexa实验方案

  敏芯测序平台包括：

1、基因组测序与重测序
2、数字表达谱分析
3、转录组测序
4、小RNA测序
5、ChIP-Seq
6、宏基因组测序（Meta-Genomics DNA测序）

＊ 实验步骤:  （以tag profiling测序为例）

      对客户提供的mRNA(或总RNA)进行样品检测，样品检测合格后采取如下技术路线进行测序： 
      基因表达方法采用Illumina Digital Gene Expression试剂盒。选取起始1～2μg总RNA，利用OligodT的beads富集总RNA样本中mRNA，并逆转录为双链cDNA，采用4碱基识别酶DpnII酶切双链cDNA，链接Illumina adapter1，利用MmeI酶切3’端20碱基，并在3’端链接Illumina adapter2。 
    再加入Primer GX1和Primer GX2, 进行15个循环的PCR扩增（10 seconds at 98°C， 30 seconds at 60°C， 15 seconds at 72°C ，10 minutes at 72°C）。扩增后样本通过6% TBE PAGE胶回收85碱基条带，纯化后通过Illumina基因表达测序法测序。 

＊ 技术参数： 

每个通道，测序片段35个bp。 
保证测量500万Read。 
简单的数据分析： 
1）、Reads数目统计及频率分布图，将Reads比对到参考基因、基因组。 
2）、Reads在所有已知的参考基因中的位置分布情况。 
3）、不同长度的所有已知的miRNA基因被Reads覆盖的情况。 
进一步的数据分析参见详细数据分析方案。 

所有解释权归上海敏芯信息科技有限公司所有；根据客户的要求可以继续进行其他的深入分析。

具体业务包括：

-基因芯片：表达谱芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等实验及数据分析

- 高通量测序：miRNA测序、mRNA测序、基因组重测序、甲基化测序、ChIP-Seq等实验及数据分析

-蛋白质组学：蛋白质芯片（SELDI）、细胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等

- 代谢组学：液质联用（LC-MS）、气质联用（GC-MS）及核磁共振（NMR）的实验及数据分析

- 文献挖掘：提供基于pubmed数据库的关键词搜索服务

- 生物信息培训：定期举办综合性生物信息培训班，并提供上门培训服务及随到随学班

u 专利代理：提供生命科学领域的专利写作、专利润色及专利申请服务

- 实验服务：引物设计、RT-PCR、3730测序、Western Blot、2D-MS等

    目前，公司国内外客户已超过500家，合作发表了50多篇高影响因子的SCI(影响因子累计超过100分)，并参与多项国家科研项目的申请与实施。