基因单核苷酸多态性(SNP)技术服务
SNP(single nucleotide polymophism) ,即单核苷酸多态,是由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态。一般来说,一个 SNP 位点只有两种等位基因,因此又叫双等位基因。 SNP 在人基因组中的发生频率比较高,大约平均每 1000 个碱基中就有一个多态位点,是继微卫星之后的第三代遗传标记。有些 SNP 位点还会影响基因的功能,从而导致生物性状改变甚至致病。
SNP 研究包括 SNP 发现( discovery )、 SNP 验证( validation )以及 SNP 筛选( Screening or Scoring )。 广泛用于群体遗传学研究(如生物的起源、进化及迁移等方面, 将逐渐取代微卫星而成为新一代的分子生物学标记) ,和疾病相关基因的研究,在药物基因组学、诊断学和生物医学研究中起重要作用。SNP的分布不均匀,非转录序列中要多于转录序列,绝大多数位于蛋白的非编码区。虽然SNP不及RFLP和短串联重复序列STR标记变异程度高,但由于数量巨大,分布频密,因此就整体而言,其多态性要高得多。
为适应日益增长的 SNP 研究需求,和各类客户的不同需要,我们利用多套技术方案为不同客户提供量身定做的个性化服务。
1.直接测序法进行SNP分析
在所有SNP的检测方法中,对待检测片段进行直接扩增、测序是最为准确的方法,也是SNP分析的金标准。通常情况下,纯合型SNP位点的测序峰为单一峰型,而杂合型SNP位点的测序峰为套峰,因而很容易将其区分开来。通过直接测序方法进行SNP检测的检出率接近100%。
1) 技术流程:
样品基因组DNA提取 根据不同的区域进行引物设计、合成 对所有样品进行基因扩增并纯化 测序 统计与分析
2) 样品要求:
血液样品:样品为EDTA抗凝或枸椽酸钠抗凝,样品量大于1ml,样品采集后于-20℃或-80℃保存 组织样品:样品可以为新鲜组织(最好-80℃保存)、石蜡包埋组织或95%乙醇中固定的组织,组织量大于50µg 细胞、菌液等
3)提供结果:
实验流程、电泳图、测序图谱、SNP基因型统计结果等。
2. Taqman探针法(定量PCR)
客户根据自己需求挑选出自身需要的SNP后,提交给我们进行引物与探针设计与合成,整个过程大约需要2~3周。上述工作完成后,客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,帮您轻松完成大量样品的检测与分析。
1)技术特点:
1. 适合位点数量少,样本通量高的检测(每个位点需要合成两条探针,探针合成费用高)
2.应用 ABI7500定量PCR仪进行定量检测
3.操作简便,只需一步 PCR 反应,无须进行纯化和预处理,直接上机检测
4. 结果清晰,软件分析结果界面友好,标出了每个样本的基因型及荧光强度,非常直观
5.可采用ABI合成的探针或国产探针
2)样品要求:同测序法。
3)提供结果:实验流程、电泳图、定量PCR结果、统计分析结果等。
3. Beckman SNPstream UHT genotyping技术方案
客户根据自己需求挑选出自身需要的SNP后,提交给我们进行设计与评价,整个过程大约需要2~4周。
客户提供2ug的DNA样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,帮您轻松完成大量样品的检测与分析。
1)技术特点:
采用 BECKMAN 独家专利技术(单碱基引物延伸技术) 需要样品量低,速度快 可采用12重或48重PCR,进行多位点同时检测 转化率约80%,成功率约90%,准确率达 99% 流程:序列比对——引物设计( 12 重或 48 重)——引物合成——DNA抽提和定量——PCR——纯化——单碱基延伸反应——杂交——扫描——分析
2)样品要求:同测序法。
3)提供结果:实验流程、DNA电泳图、统计分析结果等。
4. Illumina Goldengate 技术方案---中通量SNP检测
客户根据自己需求挑选出自身需要的SNP后,我们将提交给Illumina公司进行评价,评分通过后,委托Illumina公司进行生产。整个评分,生产及到货过程大约需要3~4个月。
芯片到货后,客户提供2ug的DNA/样品,经确认样品质量合格我们即可进行实验,实验结果经Illumina Beadstudio分析软件进行分析,帮您轻松完成成百上千的SNP检测与分析。
1)技术特点:
利用illumina公司独有的微珠芯片专利技术,高检出率,高成功率,高准确率,为目前最佳中高通量SNP分析解决方案 极强的性价比,平均下来单个反应费用低 格式为96位点/芯片,384位点/芯片,768位点/芯片,1536位点/芯片格式 芯片订货数量应为96的倍数 流程:SNP位点选择——SNP位点评估——芯片制作(委托illumina公司、时间约3个月)——DNA抽提——片段化——芯片杂交——扫描——数据统计分析
2)样品要求:同测序法。
3)提供结果:实验流程、DNA电泳图、芯片杂交图、原始数据、标准化后的数据、统计分析结果等。
5.Illumina infinium 技术---高通量SNP检测
客户按照需求选择芯片后,提供2ug的DNA,经确认样品质量合格我们即可进行实验,实验结果经Illumina Beadstudio分析软件进行分析,帮您轻松完成数以万计的SNP检测与分析。
(1) Human 1M-duo(人类1M全基因型检测)
芯片包含了超过100万个探针信息,最大限度地涵盖了人全基因组SNP信息,专门针对基因SNPs,标签SNPs,及其他高价值的基因组区域设计探针,为研究者提供最全面的全基因组SNP分型研究工具。
在原来Human 1M产品基础上增加了一些新的位点,如:疾病相关SNP位点,基因组编码区高密度的SNP位点。
可检测位点数据:大于1.1million;位点平均间距中位值:1.5KB.
可以在一张芯片上平行检测2个样品。
ContentNumber
All markers1072820
SNPs in genes565718
nsSNPs23288
SNPs in reported CNV regions206665
Probes and SNPs in new CNV regions ~52000
SNPs in mitochondrial genome163
X-chr/Y-chr/PAR loci40097/2,283/686
SNPs within 10kb of a known ADME related gene15468
SNPs in MHC region(defined by de Bakker et al.)10073
(2)Human 660W-Quad(人类660W基因型检测)
可检测位点数目:658000个;位点平均间距中位值:2.5KB.
可以在一张芯片上平行检测4个样品。
(3)HumanCytoSNP-12(人类细胞遗传异常基因型检测)
可检测位点数目:30000个;位点平均间距中位值:10KB.
可以在一张芯片上平行检测12个样品。
(4)Cancer SNP Panel(肿瘤相关SNP芯片)
包含了400个肿瘤相关基因的约1400个SNP标记,信息来源于美国NIHSNP500肿瘤数据库:http://snp500cancer.nci.nih.gov/。有两种芯片格式可以选择:
Sentrix Universal BeadChip:每个chip可检测16个样品。
Sentrix Universal Array Matrix:每个Matrix可检测96个样品。
(5)BovineSNP50(牛全基因组分型芯片)
该芯片包含了54000个均匀间距的探针,平均间距为51.5kb,一张芯片可检测12个样品。
(6)CanineSNP20(犬全基因组分型芯片)
该芯片包含了来自于CanFam2.0库中的22000个已经证实了的SNPs,高多态性和一致性为检测家犬的基因变异提供了简便的方法。更为重要的是该芯片约1Mb长度中平均包含8个SNPs,为家犬的相关研究提供了强劲的工具。可在一张芯片上检测12个样品。
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,600名以上员工的生物科技领域集团型企业。
公司为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究、开发进程,大大提升客户研究、开发价值。
公司现已建成完整齐备的多组学检测服务平台和多组学联合大数据分析平台,提供基因组、转录组、表观组、微生物组、蛋白组、代谢组等全组学检测服务;并不断跟踪组学技术进展,近几年在单细胞测序技术、空间多组学技术(空间代谢组、空间转录组)、单细胞蛋白组技术、多组学联合分析等方面逐渐取得综合优势。
2017年,基于多组学领域多年的技术积累与沉淀,进入分子诊断领域,聚焦生殖遗传,主攻染色体遗传病、单基因遗传病以及不孕不育相关遗传病,搭建闭环式的出生缺陷防控分子诊断技术体系与产品体系,致力于优生优育,幸福中国家庭。欧易生物先后与中国海洋大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所等机构建立了紧密的产学研合作,与日立诊断产品有限公司共建联合研发实验室,与华东师范大学合作建立院士专家工作站,并陆续获得闵行区研发机构、闵行区科技小巨人企业、上海市科技小巨人企业等资质。还获得知识产权管理体系认证企业资质,总授权发明专利27项、在审发明专利36项、授权软件著作权143项。
“欧易生物”始终坚守“硬数据,好服务”的价值理念,高度重视数据质量及客户服务体验,不断打造自身的“服务力”,倾听客户心声,珍视客户委托,始终将客户满意作为工作质量评价的首要标准,全力打造“创新多组学”优势品牌。
秉承“正直、开放、务实、奋进”价值观的欧易人,正努力践行“以生物科技,成就他人,造福大众”的企业使命,在生命科学及大健康领域奋发有为,以先进的组学技术服务助力基础研究,推动科技创新;以优秀的精准产品造福大众健康,幸福千万家庭。并为将“欧易生物”打造成“受人尊敬的生物科技公司”而奋斗不息!
产品架构
单细胞测序
单细胞转录组测序
空间转录组测序
Xenium 组织空间原位分析技术
FLEX单细胞转录组测序
单细胞免疫组库(VDJ)
单细胞多模态(ATAC+转录组)
单细胞样本制备试剂盒
酵母文库
泛素E3文库筛选
膜体系文库构建
核体系文库构建
转录因子文库筛选
酵母文库筛选
筛库配套试剂
转录组学
Small RNA测序
真核生物转录组测序
全转录组测序
基因组学
低深度重测序(LcWGS)
简化基因组测序(2b-RAD/Super-GBS)
基因组重测序
外显子测序
微生物组学
单细胞微生物基因组测序
微生物多样性测序
宏基因组测序
疑难样本微生物多样性测序(2bRAD-M)
细菌基因组 de novo 测序
表观组学
RNA甲基化测序(m6A)
935k甲基化芯片
全基因组甲基化测序(WGBS)
简化基因组甲基化测序(MethylRAD)
CUT&Tag测序
蛋白质组学
靶向蛋白质组学(PRM)
修饰蛋白质组学
标记定量蛋白质组学(iTRAQ/TMT)
代谢组学
空间代谢组学
非靶向代谢组学
靶向代谢组
拟靶向代谢组(脂质代谢组学)
多组学服务
多组学联合分析
合作服务平台
RACS-Seq 单细胞拉曼分选-测序耦合系统
细胞服务平台
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上海市闵行区联航路
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