简化基因组(2b-RAD/Super-GBS)-欧易生物
简化基因组(2b-RAD/Super-GBS)
简化基因组测序(Reduced-Representation Genome Sequencing, RRGS)是指选用合适的限制性内切酶消化基因组DNA,选择其中的特征性目标片段,经二代测序和生物信息学分析,可不依赖参考基因组,就能获取基因组目标片段序列信息的技术。
经过对一些常见的简化基因组测序技术(如:RAD-seq、GBS等)进行综合对比,我们推荐2b-RAD和Super-GBS为科研用户提供服务。基于目前的项目经验,这两项技术已能互补应对大多数物种。
2b-RAD
2b-RAD技术使用IIB型限制性核酸内切酶(如BsaXI)对基因组DNA进行酶切,切割位点位于识别位点的左右两侧,酶切后产生等长的33 bp的标签, 这些标签经过富集后用于高通量测序, 通过生物信息学分析实现全基因组范围高通量SNP筛查和分型分析。
Super-GBS(Genotyping-by-Sequencing)
是基于GBS进一步发展出的简化基因组测序技术,其原理是使用限制性核酸内切酶将基因组DNA进行酶切,然后对酶切片段进行高通量测序,通过分析获得SNP信息并进行基因分型,是一种快速、简便、低成本的基因分型方法。
技术优势
2b-RAD
适用于降解样品、痕量样品(ng级DNA)
技术重复性好,标签长度一致、测序深度均一,SNP准确性和利用率高
助力发高水平文章
提供大片段缺失分析
项目经验丰富(项目物种涵盖动物、植物、微生物,共150多种;有参、无参均可)
Super-GBS
实验建库流程简单快捷
无参物种标记产出高
助力多倍体物种的研究
测序数据量不受基因组大小影响
有效避开重复序列
应用方向
高密度遗传图谱构建与QTL定位
全基因组关联分析(GWAS)
群体遗传/群体进化/系统发育
分子育种——分子标记辅助育种
分子育种——全基因组选择育种
种质资源鉴定——DNA指纹图谱
种质资源鉴定 — — 分子标记开发
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,600名以上员工的生物科技领域集团型企业。
公司为大生命科学、大健康相关研究领域,以及医药、食品及日化企业的客户,提供从基础研究到药物靶点发现、药理药效及安全性评价、疾病分子标志物筛选、致病菌及耐药菌溯源等相关技术服务,全力加速客户研究、开发进程,大大提升客户研究、开发价值。
公司现已建成完整齐备的多组学检测服务平台和多组学联合大数据分析平台,提供基因组、转录组、表观组、微生物组、蛋白组、代谢组等全组学检测服务;并不断跟踪组学技术进展,近几年在单细胞测序技术、空间多组学技术(空间代谢组、空间转录组)、单细胞蛋白组技术、多组学联合分析等方面逐渐取得综合优势。
2017年,基于多组学领域多年的技术积累与沉淀,进入分子诊断领域,聚焦生殖遗传,主攻染色体遗传病、单基因遗传病以及不孕不育相关遗传病,搭建闭环式的出生缺陷防控分子诊断技术体系与产品体系,致力于优生优育,幸福中国家庭。欧易生物先后与中国海洋大学、中国科学院遗传与发育生物学研究所等机构建立了紧密的产学研合作,与日立诊断产品有限公司共建联合研发实验室,与华东师范大学合作建立院士专家工作站,并陆续获得闵行区研发机构、闵行区科技小巨人企业、上海市科技小巨人企业等资质。还获得知识产权管理体系认证企业资质,总授权发明专利27项、在审发明专利36项、授权软件著作权143项。
“欧易生物”始终坚守“硬数据,好服务”的价值理念,高度重视数据质量及客户服务体验,不断打造自身的“服务力”,倾听客户心声,珍视客户委托,始终将客户满意作为工作质量评价的首要标准,全力打造“创新多组学”优势品牌。
秉承“正直、开放、务实、奋进”价值观的欧易人,正努力践行“以生物科技,成就他人,造福大众”的企业使命,在生命科学及大健康领域奋发有为,以先进的组学技术服务助力基础研究,推动科技创新;以优秀的精准产品造福大众健康,幸福千万家庭。并为将“欧易生物”打造成“受人尊敬的生物科技公司”而奋斗不息!
产品架构
单细胞测序
单细胞转录组测序
空间转录组测序
Xenium 组织空间原位分析技术
FLEX单细胞转录组测序
单细胞免疫组库(VDJ)
单细胞多模态(ATAC+转录组)
单细胞样本制备试剂盒
酵母文库
泛素E3文库筛选
膜体系文库构建
核体系文库构建
转录因子文库筛选
酵母文库筛选
筛库配套试剂
转录组学
Small RNA测序
真核生物转录组测序
全转录组测序
基因组学
低深度重测序(LcWGS)
简化基因组测序(2b-RAD/Super-GBS)
基因组重测序
外显子测序
微生物组学
单细胞微生物基因组测序
微生物多样性测序
宏基因组测序
疑难样本微生物多样性测序(2bRAD-M)
细菌基因组 de novo 测序
表观组学
RNA甲基化测序(m6A)
935k甲基化芯片
全基因组甲基化测序(WGBS)
简化基因组甲基化测序(MethylRAD)
CUT&Tag测序
蛋白质组学
靶向蛋白质组学(PRM)
修饰蛋白质组学
标记定量蛋白质组学(iTRAQ/TMT)
代谢组学
空间代谢组学
非靶向代谢组学
靶向代谢组
拟靶向代谢组(脂质代谢组学)
多组学服务
多组学联合分析
合作服务平台
RACS-Seq 单细胞拉曼分选-测序耦合系统
细胞服务平台
单位名称: |
详细地址:
上海市闵行区联航路
|
qq:
|
官网: |
联系电话: |
Email: |