测序/合成

lncRNA测序

基本信息
服务名称:
lncRNA测序
英文名称:
long non-code RNA sequencing
参考报价:
总点击数:
848
更新日期:
2014-01-15
服务类别:

服务详情

 

        在最近十余年的生命科学研究中,对具有重要调控功能的非编码RNA的研究可谓是其中最引人关注的领域之一,而长链非编码RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)一经登场,便迅速成为非编码RNA界又一个耀眼的明星。lncRNAs是一类长度大于200 nt的非编码RNA,广泛存在于各种生物体内,在表观遗传、转录以及转录后等多种水平上对生命活动进行关键性的调控,与动植物的生长发育,人类的疾病发生有着密切关系,也可作为疾病诊断的标志物或是重要靶点。联川生物推出的lncRNA测序服务,使用高通量测序技术结合最新的生物信息学分析平台,助您全面深入地开启lncRNA研究。 
 
 
采用核糖体去除技术和链特异性文库构建方案,保留了完整的lncRNA和mRNA序列,以及序列方向性。
对包括人和动植物在内的许多物种的lncRNA展开分析。
对样本中几乎全部的lncRNA和mRNA序列进行鉴定和分析。
系统收集lncRNA数据库用于鉴定已知lncRNA,并设置严格的筛选条件用于发现新lncRNA。
展开lncRNA与mRNA的关联分析,深入分析lncRNA调控网络。
 
 
 
 
Gut :利用测序技术研究 lncRNA 对食管癌增殖与转移的调控作用 

本研究采用RNA-Seq技术,对食管腺癌组织和配对的正常组织中的lncRNA进行鉴定和差异表达分析。共发现6216个lncRNAs在食管腺癌组织中表达,其中lncRNA HNF1A-AS1显著过表达。敲除HNF1A-AS1能抑制食管腺癌细胞的增殖与转移,并抑制癌症相关lncRNA H19的表达。研究表明,HNF1A-AS1的失调参与了食管癌的发生,而该参与过程有可能部分受到染色质与核小体组装的改变及H19诱导的调节。 

Yang X. et al.(2013)Long non-coding RNA HNF1A-AS1 regulates proliferation and migration in oesophageal adenocarcinoma cells. Gut. doi: 10.1136/gutj
nl-2013-305266.
 


New Phytol :利用测序技术研究拟南芥 lncRNA 应答尖孢镰刀菌侵染的分子机制 

      尖孢镰刀菌(F. oxysporum)是一种世界性分布的土传病原真菌,寄主范围广泛,可引起包括拟南芥和重要经济作物如棉花和番茄等100多种植物发生枯萎病,造成严重损失。
本研究采用链特异性RNA-Seq技术,对拟南芥中应答F. oxysporum侵染的lncRNA展开分析。实验发现许多与F. oxysporum侵染应答相关的lncRNA,包括15个长链非编码天然反义转录本(lncNATs)和20个lincRNAs。实验证实上述部分的lncNATs和lincRNAs与拟南芥的F. oxysporum抗性密切相关。研究表明,链特异性RNA-Seq是发现隐藏着的转录组的有力工具,并证实lncRNAs是拟南芥抗真菌网络中重要的节点。
 

Zhou QK.(2013)Long noncoding RNAs responsive to Fusarium oxysporum infection inArabidopsis thaliana. New Phytology. DOI: 10.1111/nph.12537
 

 

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联川生物,总部位于美国休斯敦(LC Sciences, LLC),经过多年的快速发展,已成为业界领先的全组学技术服务商。公司拥有具有自主知识产权的µParaflo®微流体定制化芯片平台,可以为科研用户提供从基因组,转录组,到蛋白组的高通量定制化表达谱芯片解决方案。我们是全球首家提供microRNA表达谱芯片分析的服务商。作为国内最早提供高通量测序技术服务的公司之一,联川生物拥有经验丰富的技术团队和一流的生物信息学专家组,可以为研究人员提供多组学测序服务和深度个性化数据解决方案。全球科研用户使用联川生物产出的高质量组学实验数据已发表了数量庞大的论文,其中CellNatureScience及其子刊上已累计发表论文十七篇。


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