测序/合成

蛋白质测序技术服务Denovo Edman

基本信息
服务名称:
蛋白质测序技术服务Denovo Edman
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总点击数:
6890
更新日期:
2025-02-14
服务类别:

服务详情

 

 

1.N端测序

  

服务内容

   质谱方法在蛋白质测序中成为核心部分,带来的结果是蛋白质分析鉴定上的是高通量、自动化与精确性。同时Edman降解方法仍然是难度比较高的蛋白测序的重要补充。

本公司可开展蛋白质的N-端氨基酸序列测定工作:一次可以连续测定30个以上氨基酸

 

仪器(岛津PPSQ-21测序仪)

 

Edman化学降解测序介绍
    蛋白质和多肽N-端测序技术是以Edman化学降解法为基础的,Edman化学降解,其基本原理是包括通过异硫氰酸苯脂与蛋白质和多肽的N-端残基的偶联,苯氨基硫甲酰酞(PTC-肽)环化裂解,和噻唑呤酮苯氨(ATZ)转化为苯异硫尿氨基酸(PTH- 氨基酸)三个主要的化学步骤,每个循环从蛋白质与多肽裂解一个氨基酸残基,同时暴露出新的游离的氨基酸进行下一个Edman降解,最后通过转移的PTH-氨基酸鉴定实现蛋白质序列的测定。因为技术原因,Edman降解无法处理N端被封闭的蛋白或多肽,例如N端被甲基化、乙酰化等的,这些蛋白多肽无法正常测序,如果确有必要的话可以考虑用蛋白酶将蛋白切割为多肽,对所得的多肽纯化后测序。因为蛋白测序判读的依据为每次化学降解所得到的氨基酸的色谱图,因此Edman降解法对于蛋白多肽的纯度要求比较高,一般要求在90%以上,而且不能含有诸如SDS等变性剂以及盐,并且对样品本身的绝对量要求也比较高。

 

应用领域

1.样品来源:动物,植物,微生物等

2.样品种类:天然蛋白,表达蛋白,融合蛋白,合成多肽等

3.纯化方式:液相纯化,二维电泳分离,PVDF转膜等

 

样品要求

1.含量:建议送样量不低于 50pmol

2.状态:液体、冻干粉或PVDF转膜样品均可

3.纯度:建议95%以上纯度

4.性质:注明其溶解性,挥发性,毒性/腐蚀性等

5.信息:表观分子量;修饰信息;样品组织来源及制备方法信息

6.其它:A. N端未封闭

B.缓冲液中不要包含氨基酸成分,如甘氨酸

C.不含干扰物质:去污剂、胺、盐、氨基酸、非挥发性缓冲液、蛋白酶等

D.样品需要转膜制备时,建议将样品交由我们代为处理,并同时提供相应的电泳方法与带有mark的电泳照片

E. 样品如有特殊理化性质(如膜蛋白,特殊酶活性,特殊结构等),请详细说明

F. 若为已知序列样品,请告知预期序列信息

 

实例

 

 

2.蛋白denovo测序:

适用于多氨基酸残基(如几百个以上)的多肽及蛋白测全长,

酶切加质谱,软件分析

酶:Trypsin、Chymotrypsin、Glu-C、Lys-C、ASP-N
 

抗体和重组蛋白全长测序常见问题
1,测序需要多少量抗体?
(1) 蛋白从头测序标准的送样量是 100ug,纯度是 90%以上。
(2) 有最低 20ug 测序成功的经验。蛋白纯度对测序结果的影响较大,杂的抗体蛋白、
同源蛋白及 BSA 等会对样品测序产生干扰,从而影响实验结果。
(3) 蛋白溶解缓冲液标准的送样建议是使用 PBS 或 Tris 缓冲液体系,此外如果有甘油、
BSA、去垢剂、盐等成分,我们会有相应的方法做一些纯化处理,所以是不影响测
序结果的。
2,测序是单抗还是多抗?
(1) 单抗,重组蛋白。
(2) 蛋白从头测序和蛋白的大小长度无关,单抗、Fab/Fc、纳米抗体、重组蛋白、多肽、
荧光标记抗体(如流式抗体 FITC、Cyc5、PE 等标记的抗体)、交联抗体(蛋白交
联在 Beads 上)等均可以进行从头测序。
(3) 样品糖基化和翻译后修饰不会影响测序:数据分析时会将可能的翻译后修饰和糖基
化修饰考虑在内,不影响样品本身测序结果。
3,测序的周期是多长?
(1) 符合送样要求,从开始检测到报告发送标准的服务周期是 14 个工作日。
(2) 符合送样要求,可加急,做到 14 个自然日。
(3) 顺利的话,某些项目可加急做到 7 个工作日(9 个自然日)
4,测序的结果怎么提供?
(1)邮件发送结果
(2)完整报告内容包括但不限于以下信息
①完整的蛋白氨基酸序列,抗体包括重链和轻链序列,恒定区和可变区。
②完整分子量验证信息,将实际测得的分子量与理论序列分子量进行比对来验证序列
的准确性(偶联到 beads 上的抗体不提供抗体完整分子量信息)。
③完整序列的肽段覆盖图,每个位点的氨基酸有超过 3 种不同的肽段支持。
④抗体可变区肽段的二级质谱图支撑。
⑤I/L 鉴定的可信度分析。
5,测序的准确性如何?
(1) 测序结果保证全序列覆盖和 100%序列准确,每个位点的氨基酸有超过 3 种不同的
肽段支持,每个氨基酸在质谱图里有强的碎片离子峰证据。测序结果结合软件算法
和人工检验,双重保证序列准确性。
(2) 针对于单抗,有一个区别于经典款的保活款单抗测序项目(保活款与经典款测序流
程一致,区别只在于价格和风险承担方式,一般不建议):
1
交付 3 毫克重组抗体。客户测试亲和性成功以后交付轻重链全长序列以及报告,
价格比全长测序服务增加 1.0 万元,周期增加 20 工作日;
2
客户检测没有活性,不收取费用、不交付轻重链全长序列和报告;
 

 

公司简介

    西农生(北京)生物技术有限公司是开展蛋白质组技术专业服务的生物技术公司,搭建了以Amersham的高通量双向电泳系统和Bruker公司最先进的autoflex II TOF/TOF质谱系统为基础的,配以样品处理及蛋白质数据分析为辅的蛋白质技术平台,提供从样品处理到2D胶,直到质谱鉴定及数据分析的全流程服务。

   公司拥有样品前处理实验室及二维电泳实验室,质谱(bruker autoflex II TOF/TOF)实验室等,工作由具有蛋白组技术经验的技术人员完成,主要员工均具有硕士以上学历,多年从事蛋白技术实践经验.公司已与全国多家医院,高校及科研院所开展了及正在开展蛋白质组课题的合作。
客户名单如下:
医院:北医三院,解放军309医院,北京朝阳医院,四川大学华西医院,昆明延安医院等。
高校:中国农业大学,北京农学院,北京林业大学,河南农业大学,内蒙古农业大学,青海大学,重庆医科大学,新疆医科大学等。
科研院所:中科院遗传与发育所,中科院海洋所,中科院农业资源中心,中国林业科学研究院,医科院药植所,医科院病原所,中国CDC营养所,山东省农科院等。


详情请登陆http://www.scilongs.com 有案例

开展蛋白质组,蛋白纯化及测序,代谢组,生物信息技术等服务,详情请登陆http://www.scilongs.com

 


售后服务
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