蛋白质测序技术服务Denovo Edman
1.N端测序
服务内容
质谱方法在蛋白质测序中成为核心部分,带来的结果是蛋白质分析鉴定上的是高通量、自动化与精确性。同时Edman降解方法仍然是难度比较高的蛋白测序的重要补充。
本公司可开展蛋白质的N-端氨基酸序列测定工作:一次可以连续测定30个以上氨基酸
仪器(岛津PPSQ-21测序仪)
Edman化学降解测序介绍
蛋白质和多肽N-端测序技术是以Edman化学降解法为基础的,Edman化学降解,其基本原理是包括通过异硫氰酸苯脂与蛋白质和多肽的N-端残基的偶联,苯氨基硫甲酰酞(PTC-肽)环化裂解,和噻唑呤酮苯氨(ATZ)转化为苯异硫尿氨基酸(PTH- 氨基酸)三个主要的化学步骤,每个循环从蛋白质与多肽裂解一个氨基酸残基,同时暴露出新的游离的氨基酸进行下一个Edman降解,最后通过转移的PTH-氨基酸鉴定实现蛋白质序列的测定。因为技术原因,Edman降解无法处理N端被封闭的蛋白或多肽,例如N端被甲基化、乙酰化等的,这些蛋白多肽无法正常测序,如果确有必要的话可以考虑用蛋白酶将蛋白切割为多肽,对所得的多肽纯化后测序。因为蛋白测序判读的依据为每次化学降解所得到的氨基酸的色谱图,因此Edman降解法对于蛋白多肽的纯度要求比较高,一般要求在90%以上,而且不能含有诸如SDS等变性剂以及盐,并且对样品本身的绝对量要求也比较高。
应用领域
1.样品来源:动物,植物,微生物等
2.样品种类:天然蛋白,表达蛋白,融合蛋白,合成多肽等
3.纯化方式:液相纯化,二维电泳分离,PVDF转膜等
样品要求
1.含量:建议送样量不低于 50pmol
2.状态:液体、冻干粉或PVDF转膜样品均可
3.纯度:建议95%以上纯度
4.性质:注明其溶解性,挥发性,毒性/腐蚀性等
5.信息:表观分子量;修饰信息;样品组织来源及制备方法信息
6.其它:A. N端未封闭
B.缓冲液中不要包含氨基酸成分,如甘氨酸
C.不含干扰物质:去污剂、胺、盐、氨基酸、非挥发性缓冲液、蛋白酶等
D.样品需要转膜制备时,建议将样品交由我们代为处理,并同时提供相应的电泳方法与带有mark的电泳照片
E. 样品如有特殊理化性质(如膜蛋白,特殊酶活性,特殊结构等),请详细说明
F. 若为已知序列样品,请告知预期序列信息
实例
2.蛋白denovo测序:
适用于多氨基酸残基(如几百个以上)的多肽及蛋白测全长,
酶切加质谱,软件分析
酶:Trypsin、Chymotrypsin、Glu-C、Lys-C、ASP-N
西农生(北京)生物技术有限公司是开展蛋白质组技术专业服务的生物技术公司,搭建了以Amersham的高通量双向电泳系统和Bruker公司最先进的autoflex II TOF/TOF质谱系统为基础的,配以样品处理及蛋白质数据分析为辅的蛋白质技术平台,提供从样品处理到2D胶,直到质谱鉴定及数据分析的全流程服务。
公司拥有样品前处理实验室及二维电泳实验室,质谱(bruker autoflex II TOF/TOF)实验室等,工作由具有蛋白组技术经验的技术人员完成,主要员工均具有硕士以上学历,多年从事蛋白技术实践经验.公司已与全国多家医院,高校及科研院所开展了及正在开展蛋白质组课题的合作。
客户名单如下:
医院:北医三院,解放军309医院,北京朝阳医院,四川大学华西医院,昆明延安医院等。
高校:中国农业大学,北京农学院,北京林业大学,河南农业大学,内蒙古农业大学,青海大学,重庆医科大学,新疆医科大学等。
科研院所:中科院遗传与发育所,中科院海洋所,中科院农业资源中心,中国林业科学研究院,医科院药植所,医科院病原所,中国CDC营养所,山东省农科院等。
详情请登陆http://www.scilongs.com 有案例
开展蛋白质组,蛋白纯化及测序,代谢组,生物信息技术等服务,详情请登陆http://www.scilongs.com
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