芯片与生物信息学

甲基化芯片数据分析服务

基本信息
服务名称:
甲基化芯片数据分析服务
英文名称:
CPG,microarray
参考报价:
021-31523052
总点击数:
2412
更新日期:
2014-04-01
服务类别:

服务详情

 

 

甲基化芯片分析方案

 
 
  
       为了消除实验的误差、生物样品个体差异及噪声等产生的影响,将数据进行归一化处理。
 
 
 
        如果该芯片中的探针注释并非由基因组序列设计产生,而是由实验克隆测序直接生成序列,在向基因组BLAST比对的时候,有时会没有对应。需要对其进行重新注释,获得探针的基因组序列。
 
 
 
       我们将原有的基因列表进行了重新注释,原有的注释一般只提供了CpG岛位于哪个基因之内,即within, 实际上一个启动子的范围要大得多,因此我们加入了一些CpG岛上游(upstream)和下游基因(downstream)的注释。
 
 
项目四:差异CpG岛的筛选(必选)
     
     取表达2倍差异的基因:
 
 
项目五:转录因子预测分析(推荐)
 
]   扫描CpG岛区域的转录因子结合位点。因为一般情况下甲基化会使转录因子与DNA的结合力下降,导致基因转录水平的降低。因此转录因子的分析可以解释甲基化导致转录抑制的机理。
 
  
项目六:甲基化显著基因的Gene Ontology分析(推荐)
 
 
项目七:甲基化显著基因的pathway分析(推荐)
 
 
 
 

 

 

 

 

 

详情请查看公司网站:www.sensichip.com.cn

公司简介
上海敏芯信息科技有限公司
 
    上海敏芯信息科技有限公司成立于2006年10月,是国内知名的生物信息学服务提供商。随着业务扩展,公司已经发展成为国内第一家专业提供系统生物学服务的高科技企业,提供包括基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学相关的实验设计、实验检测、数据分析、结果验证及论文修改的全面解决方案。公司已获得国家及上海市中小企业创新基金、上海市科技创新行动计划、上海市大学生创业基金、上海市专利试点企业、上海市技术成果转化认证、上海市杨浦区人才资助资金等多项国家及省部级奖励。

具体业务包括:

-基因芯片:表达谱芯片、miRNA芯片、SNP芯片、甲基化芯片、Exon芯片、Tilling芯片、lncRNA芯片等实验及数据分析

- 高通量测序:miRNA测序、mRNA测序、基因组重测序、甲基化测序、ChIP-Seq等实验及数据分析

-蛋白质组学:蛋白质芯片(SELDI)、细胞因子芯片、ITRAQ、Shotgun Proteomics、DIGE-2D等

- 代谢组学:液质联用(LC-MS)、气质联用(GC-MS)及核磁共振(NMR)的实验及数据分析

- 文献挖掘:提供基于pubmed数据库的关键词搜索服务

- 生物信息培训:定期举办综合性生物信息培训班,并提供上门培训服务及随到随学班

u 专利代理:提供生命科学领域的专利写作、专利润色及专利申请服务

- 实验服务:引物设计、RT-PCR、3730测序、Western Blot、2D-MS等

    目前,公司国内外客户已超过500家,合作发表了50多篇高影响因子的SCI(影响因子累计超过100分),并参与多项国家科研项目的申请与实施。


售后服务
联系方式
单位名称:
详细地址:
上海市祁连山南路2891弄105号
qq:
1781172445
官网:
联系电话:

021-56413052

Email:

在线询价
*姓名:
*单位:
职位:
*手机:
*邮箱:
地址:
*地区:
资料:
需要
不需要
报价:
需要
不需要
留言:
验证码:
我希望获得多家供应商报价
首页 我的账户 立即询价 电话咨询