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WB操作规程
一.设备和试剂
1.设备
① 电泳电源
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell,Mini Teans-Blot Module,and PowerPac Basic Power Supply (BIO-RAD,Catalog#165-3323)
② 电泳仪及附件
Mini-PROTEAN 3 Elecreophoresis Cell (BIO-RAD,Catalog#165-3301)
③ 电转仪及附件
Mini Teans-Blot Elecreophoresis Transfer Cell (BIO-RAD,Catalog#170- 3930)
④ NC膜
PIERCE,Catalog#88018
⑤ 滤纸
Whatman,3MM CHR
2.试剂
① 凝胶试剂(实验室常备)
试剂名称 |
厂家 |
30%丙烯酰胺溶液 |
SIGMA |
Tris-Base |
SIGMA |
10%SDS |
SIGMA |
10%过硫酸铵 |
SIGMA |
TEMED |
SIGMA |
②Total protein Extraction Kit ,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200501
Renewable Buffer膜再生液,ProMab•美国,Cat. No:SJ-200512
天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK•德国,Cat. No: 444810
天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK•德国,Cat. No:71183-3
Bradford蛋白浓度测定试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:BRAKIT
细胞核蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1001
细胞膜蛋白与细胞浆蛋白抽提试剂盒,嘉美生物•中国,Cat. No:P1003
③ 常用溶液及缓冲液
A.5%积层胶所用溶液
按总体积2.5ml:
ddH2O:1.7ml
30%丙烯酰胺溶液:0.42ml
1.0mol/L Tris (PH=6.8):0.315ml
10%SDS:25ul
10%过硫酸铵:25ul
TEMED:3ul
B.分离胶溶液配方参考表
C.电泳缓冲液,1L
3g Tris-Base、14.4g 甘氨酸、1g SDS,加蒸馏水至IL,pH应该在8.3左右。也可以制成10×的储存液,在室温下长期保存。
D.电泳转移缓冲液,1L
3g Tris-Base、14.4g 甘氨酸、甲醇200ml, 加蒸馏水至1L, 也可以制成10×的储存液,在湿温下长期保存。
E.5×样品缓冲液,10ml
0.6ml 1mol/L的Tris-HCl(Ph6.8)、5ml 50%的甘油、2ml 10%的SDS、0.5ml 2-巯基乙醇、1ml 1%溴酚蓝,0.9ml的蒸馏水,可在4℃保存数周,或在-20℃保存数月。
④ 二抗稀释液
用1%BSA-PBS(含0.05%TWEEN20)稀释。
常用Secondary Antibody :
Rabbit Anti Goat IgG/HRP,嘉美生物, SEH0103,(1:10,000~40,000)
Goat Anti Rabbit IgG/HRP (SCBT, Catalog# sc-2030,1:10,000~40,000)
Goat Anti Mouse IgG+A+M(H+L)/HRP, ZYMED, #62-64201(1:40,000~100,000)
Goat anti-rat IgG-HRP,SANTA, sc-2032(1:5 000~1:10 000)
二.蛋白提取(根据样品及检测要求选取以下适当提取方法)
A-1.组织裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).用剪刀剪取约0.5mg组织,置于组织匀浆器中,加入1ml 总蛋白提取液,匀浆5min~20min直到组织充分破碎,然后冰上放置10~20min后,再匀浆5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中
4).-20℃冻存。
A-2.组织裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).以下组织的处理应当尽快转移到 4℃无菌器皿中,如结缔组织,脂肪 血管等,最理想的组织应当切成2到3mm的碎块,然后转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).组织碎块在100×g 4℃条件下离心2分钟,小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).转移适当量的细碎切块 (可能冰冻的) 到一个预冷的匀浆器。 (最好是一个玻璃或石英制品),向匀浆器中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取组织块。
7).小心地匀浆组织碎块,可以使用杵磨碎组织细块直到它们成为冰冷的混合体 (例如 牛的肝脏需要10 下) ,尽可能使碎块看不见。需要的用杵磨的次数取决于组织的结构。如果需要提高效率,可以事先使用显微镜观察其结构。目的是为了得到单个细胞,而非对组织进行支离破碎。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在4℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到匀浆器中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
A-3.组织裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).取约1~20mg适量的冻存组织置于EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
B-1.细胞裂解提取总蛋白 (采用Total protein Extraction Kit,ProMab, Cat. No:SJ-200501 )
1).细胞收集好,加入1ml 总蛋白提取液,充分吹打,然后冰上放置10~20minmin后,再吹5min~20min,将匀浆液吸出放到1.5ml离心管中。
2).超声3次,每次3s。
3).9000rpm,离心10min,取适量上清置于新的1.5ml离心管中。
4).-20℃冻存。
B-2.细胞裂解提取膜蛋白(采用天然膜蛋白抽提试剂盒ProteoExtract™ (M-PEK),MERCK,Cat. No: 444810)
1).确定缓冲液充分融解,且被旋涡器充分混合。在抽提过程中缓冲液1和 2 保持在冰上并和蛋白酶抑制剂混合。
2).将细胞收集好转入一个装有2ml冰冷缓冲液的管中洗涤。
3).轻轻弹打试管几次冲散血细胞和其它松散物质。
4).在100×g 4℃条件下离心2分钟, 小心移去上清液且保证没有沉淀丢失。
5).加入2毫升冰冷缓冲液洗涤,重复步骤3和4洗涤,在最后的洗涤步骤之后,小心完全地除去所有的缓冲液。
6).向装有洗涤好的细胞的管中加入10ul 蛋白酶抑制剂,并立即加入2毫升冷的缓冲液1 萃取细胞。
7).小心地吹打细胞,尽可能使细胞看不见。
8).尽可能完全地转移混合物到一支预冷的管中并在 4 ℃ 轻柔的摇动10分钟。推荐使用旋转式振动器可以避免细胞结团的形成。
9).在16,000 x g和 4 ℃ 15 min条件下分离不能溶解的材料。
10).丢弃上清液(丰富的“可溶性”蛋白质,此蛋白溶液 可用于内参检测)或使用吸移管转移它到样品管,无需干扰底层细胞。切记分离所有液体。 如果需要应当保留成数份冰冻以便以后分析。
11).放入5ul蛋白酶抑制剂到管中充分混匀,并立即加入1毫升冰冷缓冲液2萃取细胞团.,使用吸移管仔细地完全地重悬细胞团。在30分钟 4 ℃条件下轻柔的摇动。 推荐一台旋转式振动器避免细胞团的形成。
12).在16,000 x g和 4℃ 15 min条件下 分离不能溶解的材料。
13).使用吸移管完全转移上层清液(包括丰富的膜相关蛋白质)到样品管,无需吸入细胞残渣。
B-3.细胞裂解分离提取浆/核蛋白 (采用天然浆/核蛋白分离抽提试剂盒NucBuster TM Protein Exaction Kit ,MERCK,Cat. No:71183-3)
1).使用前浆冷冻的Protease Inhibitor Coctail Set 1 溶于100ul 灭菌水配成100 ×体积,分装冻存于-20度(1~3×107细胞用1ul/100×)。
2).所有蛋白体提取过程应在冰面上操作,保持蛋白的稳定性。
3).将细胞收集好在EP管中,加入液氮使用EP管研磨杵快速研磨成粉末。
4).将适量粉末转移至预冷的1.5ml EP管中,加入150ul NucBuster Reagent 1。
5).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
6).4℃,16000g离心5min。
7).移除上清液(为胞浆蛋白成分,可用于内参检测),胞浆蛋白可以保存他用或者丢弃,再用500ul预冷的1×PBS再洗一次去除多余的胞浆蛋白。
8).在絮状沉淀中加入
1ul 100×Protease Inhibitor Coctail
1ul 100mM DTT
75ul NucBuster Exaction Reagent 2
9).高速漩涡振动15S,冰面孵育5min,再次高速漩涡振动15S。
10).4℃,16000g离心5min。
11).将上清液(核蛋白)转移至另一管,可立即使用或分装保存于-70℃。
线粒体蛋白提取见附录1
详细操作请见以下链接:
www.jiamay.net/vshow_28_2020.html
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