测序/合成

高通量测序服务——真菌基因组测序

基本信息
服务名称:
高通量测序服务——真菌基因组测序
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总点击数:
2300
更新日期:
2015-07-14
服务类别:

服务详情

高通量测序服务——真菌基因组测序

详细描述:
真菌属于较低等的真核生物,种类繁多,在自然界中分布广泛。据估计,全世界约有150万种真菌,其中包含许多具有重要的药用价值和食用价值的有益真菌,同时也存在着大量能引发动植物病害的致病菌。因此,合理利用有益真菌,控制和预防有害真菌对人类的生产和生活具有重要的意义。而真菌基因组的阐明,将为真菌特性的分析提供有用的依据。随着第二代高通量测序技术的成熟,基因组测序成本已大大降低,使得快速而经济的进行真菌基因组测序成为可能,目前真菌基因组学研究已经进入了一个快速增长时期。
 
美吉优势
1.      拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。
2.      拥有Roche 454和Illumina Solexa两种高通量测序平台,合作伙伴可根据具体需求进行选择,以获取最佳的实验结果。
3.      技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
4.      拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
 
生物信息分析
1.      De novo真菌基因组测序
1)基因组序列拼接
原始数据统计、基因组覆盖度计算、组装结果统计等。
2)基因注释
编码基因预测,基因功能注释(NR、Swiss-prot、Interpro等)、Non-coding RNA注释、重复序列注释等。
3)基因功能分类
GO分类、KEGG通路分析等。
4)比较基因组及进化分析
与近源物种的基因组序列对比,进行SNP、SV等变异结构检测、pan-genome和core-genome组成分析、同源基因分析、进化分析等。
2.      真菌基因组重测序
1)原始数据统计
2)短序列mapping至参考基因组
3)分析mapping区域reads的覆盖度、重复性、覆盖碱基的质量及reads方向
4)SNPs、InDel、CNVs检测
5)结构变异(SVs)和基因组重排事件分析
公司简介

        上海美吉生物医药科技有限公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用和推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和转化医学研究,是上海张江高科技园区、张江药谷重点支持企业,华东师范大学战略合作单位。目前,美吉生物在上海、北京、广州三个一线城市建立了实验基地,销售网络遍布全国各地。

        美吉生物拥有世界一流的测序平台,在ABI3730xl常规测序平台的基础上,先后引进了罗氏454高通量测序平台和Illumina高通量测序平台,专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、转录组测序、小RNA测序、基因表达谱分析等技术服务。

        美吉生物拥有一支实力雄厚的技术团队,有从事分子生物学研究十多年、经验丰富的技术骨干,也有创新进取、拼劲十足的希望之星。技术团队经验丰富,曾参与水稻、番茄、家蚕等多项大型基因组学项目,可以为您提供专业、合理、高性价比的实验方案。

        生物信息学是国际前沿的新兴学科,近年来发展迅猛。美吉生物拥有一支具有国际一流水平的生物信息分析团队,不仅可以提供标准流程化的生物信息分析,还可以根据不同的课题需求,提供个性化的深度数据挖掘。

        B2B(Bench to Bedside)的转化医学模式,大大缩短了医学科学从基础研究到临床应用的时间,加速了人类进入基因组医学时代的步伐。基于对未来医学发展趋势的充分理解,美吉生物和国内多家著名三甲医院联合建立了转化医学中心,开展转化医学研究,以迎接基因组医学时代的到来。

        美吉生物秉承“专业、卓越”的企业理念,“以客户为本,让客户满意”的服务宗旨,一如既往地致力于提供高品质、高效率的技术服务,努力将公司打造成为国内一流企业。因为敬业,所以专业;因为专业,所以选择;选择美吉,选择满意!


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