测序/合成

高通量测序服务——转录组测序

基本信息
服务名称:
高通量测序服务——转录组测序
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2661
更新日期:
2015-07-14
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服务详情

高通量测序服务——转录组测序

详细描述:
转录组即某个物种或特定细胞在某一功能状态下产生的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。与基因组不同的是,转录组的定义中包含了时间和空间的限定。同一细胞在不同的生长时期及生长环境下,其基因表达情况是不完全相同的。转录组测序(RNA-Seq)是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。相对于传统芯片而言,RNA-Seq无需预先设计探针,即可对任意物种的任意细胞类型的转录组进行检测,能够提供更精确的数字化信号,更高的检测通量以及更广泛的检测范围,是目前深入研究转录组复杂性的强大工具。
 
美吉优势
1.      拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作伙伴要求灵活安排实验,实验周期短,质量可靠。
2.      拥有Roche 454和Illumina Solexa两种高通量测序平台,合作伙伴可根据具体需求进行选择,以获取最佳的实验结果。
3.      技术人员经验丰富,可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
4.      拥有专业的生物信息团队和大型计算机,可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
 
生物信息分析
1.      有参考基因组的转录组分析(Transcriptome analysis with reference genome)
1)测序原始数据处理(质量剪切、污染序列去除等)
2)Contig和Unigene统计分析
3)Unigene功能注释(NR、GO 和KEGG等)
4)SNPs及SSR分析等
5)基因表达差异分析(不少于两个样品)
2.      无参考基因组转录组分析 (De novo Transcriptome Analysis)
1)测序原始数据处理(质量剪切、污染序列去除等)
2)短序列mapping至参考基因组序列
3)基因功能注释
4)基因结构分析
5)可变剪切分析
6)基因表达差异分析(不少于两个样品)
7)预测新的基因
 
成功案例
美吉生物已成功完成包括线虫、牡蛎、对虾、蜜蜂、鲫鱼、鲤鱼、鸡、猪、油菜花、菊花、桃树等多个物种的转录组测序及分析。
 
最新发表文章
Nie QH, Fang MX, Jia XZ, et al. Analysis of muscle and ovary transcriptome of Sus scrofa: assembly, annotation and marker discovery. DNA Res, 2011, published on line.
公司简介

        上海美吉生物医药科技有限公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用和推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和转化医学研究,是上海张江高科技园区、张江药谷重点支持企业,华东师范大学战略合作单位。目前,美吉生物在上海、北京、广州三个一线城市建立了实验基地,销售网络遍布全国各地。

        美吉生物拥有世界一流的测序平台,在ABI3730xl常规测序平台的基础上,先后引进了罗氏454高通量测序平台和Illumina高通量测序平台,专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、转录组测序、小RNA测序、基因表达谱分析等技术服务。

        美吉生物拥有一支实力雄厚的技术团队,有从事分子生物学研究十多年、经验丰富的技术骨干,也有创新进取、拼劲十足的希望之星。技术团队经验丰富,曾参与水稻、番茄、家蚕等多项大型基因组学项目,可以为您提供专业、合理、高性价比的实验方案。

        生物信息学是国际前沿的新兴学科,近年来发展迅猛。美吉生物拥有一支具有国际一流水平的生物信息分析团队,不仅可以提供标准流程化的生物信息分析,还可以根据不同的课题需求,提供个性化的深度数据挖掘。

        B2B(Bench to Bedside)的转化医学模式,大大缩短了医学科学从基础研究到临床应用的时间,加速了人类进入基因组医学时代的步伐。基于对未来医学发展趋势的充分理解,美吉生物和国内多家著名三甲医院联合建立了转化医学中心,开展转化医学研究,以迎接基因组医学时代的到来。

        美吉生物秉承“专业、卓越”的企业理念,“以客户为本,让客户满意”的服务宗旨,一如既往地致力于提供高品质、高效率的技术服务,努力将公司打造成为国内一流企业。因为敬业,所以专业;因为专业,所以选择;选择美吉,选择满意!


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