测序/合成

Sanger测序服务——EST测序

基本信息
服务名称:
Sanger测序服务——EST测序
英文名称:
EST
参考报价:
总点击数:
3744
更新日期:
2015-07-14
服务类别:

服务详情

Sanger测序服务——EST测序

详细描述:
EST(Expressed Sequence Tag)表达序列标签是指随机从构建的cDNA文库中挑选克隆,并进行5'端和3'端一次性测序所获得的短cDNA部分序列,一般长度为150~500bp。虽然EST只是完整基因的一部分,但是其序列长度已足以代表该基因,因此可以采用EST特异性地标记基因。目前,EST的数目比GenBank中其他核苷酸序列多,所以在EST 库中更容易搜寻到新的基因,它已被广泛地应用于基因的识别。另外,由于EST 来源于特定组织在特定环境下总mRNA所构建的cDNA文库,因此EST也能说明该组织中各基因的表达水平。

EST测序的应用 
1. 基因表达谱分析
2. SSR标记的发掘 
3. 作为构建分子标记连锁图谱所用的探针
 
基本信息分析
1. 从峰图到序列的转化,去除低质量的序列和载体序列
2. 序列拼接
3.  EST注释
4. ORF预测及分析
5. 基因注释(NRNT数据库)  
 
高级信息分析
1. 功能蛋白分析
2. Interpro功能域分析
3. 序列属性及其对应Unigene的分析
4. COG分析
5. Pathway分析

实验周期

EST测序实验周期视具体测序量而定。基本生物信息分析:少于5000条为10个工作日左右,多于5000条为15个工作日左右。


提供结果 
1. 测序峰图及序列文件
2. 生物分析报告

 

公司简介

        上海美吉生物医药科技有限公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用和推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和转化医学研究,是上海张江高科技园区、张江药谷重点支持企业,华东师范大学战略合作单位。目前,美吉生物在上海、北京、广州三个一线城市建立了实验基地,销售网络遍布全国各地。

        美吉生物拥有世界一流的测序平台,在ABI3730xl常规测序平台的基础上,先后引进了罗氏454高通量测序平台和Illumina高通量测序平台,专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、转录组测序、小RNA测序、基因表达谱分析等技术服务。

        美吉生物拥有一支实力雄厚的技术团队,有从事分子生物学研究十多年、经验丰富的技术骨干,也有创新进取、拼劲十足的希望之星。技术团队经验丰富,曾参与水稻、番茄、家蚕等多项大型基因组学项目,可以为您提供专业、合理、高性价比的实验方案。

        生物信息学是国际前沿的新兴学科,近年来发展迅猛。美吉生物拥有一支具有国际一流水平的生物信息分析团队,不仅可以提供标准流程化的生物信息分析,还可以根据不同的课题需求,提供个性化的深度数据挖掘。

        B2B(Bench to Bedside)的转化医学模式,大大缩短了医学科学从基础研究到临床应用的时间,加速了人类进入基因组医学时代的步伐。基于对未来医学发展趋势的充分理解,美吉生物和国内多家著名三甲医院联合建立了转化医学中心,开展转化医学研究,以迎接基因组医学时代的到来。

        美吉生物秉承“专业、卓越”的企业理念,“以客户为本,让客户满意”的服务宗旨,一如既往地致力于提供高品质、高效率的技术服务,努力将公司打造成为国内一流企业。因为敬业,所以专业;因为专业,所以选择;选择美吉,选择满意!


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