芯片与生物信息学

ChIP-GLAS启动子芯片技术服务

基本信息
服务名称:
ChIP-GLAS启动子芯片技术服务
英文名称:
参考报价:
询价
总点击数:
3587
更新日期:
2015-01-16
服务类别:

服务详情
服务描述
ChIP-GLAS启动子芯片技术服务是美国ASB公司开发出的世界领先的GREMATM(Gene Regulatory Elements Mapping and Analysis)技术,在染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP)的应用中处于领先地位。博奥生物通过与ASB的合作,将GREMA技术引入中国,独家为中国广大的生命科学研究人员提供高质量的ChIP-GLAS技术服务。

染色质免疫沉淀技术(chromatin immunoprecipitation, ChIP)研究也称结合位点分析法,它采用微阵列技术在染色体基因表达调控区域检查染色体活性,是深入分析癌症、心血管疾病以及中央神经系统紊乱等疾病的主要代谢通路的一种非常有效的工具。染色质免疫共沉淀技术与芯片技术相结合(ChIP-on-chip)更有助于科学家发明疾病的有效治疗方法。调控蛋白与基因组DNA结合能够控制DNA复制和基因表达,作为细胞调节网络中的开关,结合位点分析信息与基因表达数据相结合,将能有助于分析寻找生物标志物(biomarker)。转录因子通过与核酸直接的相互作用等方式在细胞内发挥着重要的转录调控作用。它们通常序列特异性地结合在基因转录起始位点上游的启动子区来调节该基因的转录。而ASB的启动子芯片技术则是用于检测单个转录因子在细胞中的某一时刻与20,000个基因启动子相互作用的情况。通过染色质免疫共沉淀(ChIP)技术和启动子芯片的有机结合,可以确定任何一个特定转录因子的靶基因群。


产品特点
该产品的核心技术ChIP-GLAS技术是由加州大学圣地亚哥分校(UCSD)付向东教授的研究小组开发,并被选定为美国国立卫生研究院(NIH)ENCODE计划中技术发展期的主要技术之一。
该产品特点除了操作简单,成本低之外,还包括:
★ 容易地与经典的DNA微阵列芯片技术和结果整合,操作方便
★ 涵盖20000个功能基因的启动子序列
★ 固定在芯片上的每条探针是40nt的寡核苷酸序列,每个探针对应一个基因
★ 采用独特的ChIP-GLAS技术,特异性大大提高,灵敏度比传统ChIP-Chip技术高2-3个数量级
★ 一次实验可以完成被检测的转录因子对20000个基因的转录调控分析


服务流程
★ 客户需要提供生物样品和具有ChIP活性的转录因子的抗体
★ 对生物样品进行甲醛交联
★ 超声破碎基因组DNA
★ 染色质免疫共沉淀
★ 荧光标记
★ 芯片杂交
★ 芯片扫描
★ 数据分析
★ 数据保存和结果报告

服务优势
★ 高通量:一次实验可以完成被检测的转录因子对全基因组范围内的2万个基因的转录调控研究
★ 高灵敏度和高特异性:与传统ChIP-Chip技术中的标记方法(LM-PCR)不同,本芯片采用了GLAS(Guided Ligation And Selection)标记技术,使检测灵敏度提高了3个数量级,同时特异性也得到了显著的增强
★ 严格的质控体系:为了保证实验结果的可靠性,从基因组DNA超声片断的大小到染色质免疫共沉淀的成功与否都有完善的质控措施
★ 专业的服务队伍:本公司的启动子芯片技术平台上投入了多位分子生物学和生物信息学的专家,除了为客户提供全方位的服务外,还可参与到对方的实验设计之中,为发表高质量的文章献计献策

参考文献
· Ren B, Robert F, Wyrick JJ, Aparicio O,Jennings EG,Simon I, Zeitling J, Schreiber J, Hannett N, Kanin E,Volkert TL, Wilson CJ, Bell SP, Young RA.(2000). Genome-wide location and function of DNA binding proteins. Science.290(5500):2306-9
· Lyer VR, Horak CE, Scafe CS, Botstein D, Snyder M, Brown PO.(2001). Genomic binding sites of the yeast cell-cycle transcription factors SBF and MBF. Nature. 409(6819):533-8
· Ren B, Cam H, Takahashi Y, Volkert T, Terragni J, Young RA, Dynlacht BD. (2002). E2F integrates cell cycle progression with DNA repair, replication, and G(2)/M checkpoints. Genes and Development. 16(2):245-56
· Li Z, Van Calcar S, Qu C, Cavenee WK, Zhang MQ, Ren B.(2003). A global transcriptional regulatory role for c-Myc in Burkitt´s lymphoma cells. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 100(14):8164-9
· Blancafort P, Magnenat L, Barbas CF 3rd..(2003). Scanning the human genome with combinatorial transcription factor libraries. Nature Biotechnology. 21(3):269-74

订购信息
ChIP-GLAS系统包括微阵列芯片和试剂盒两部分,可以单独购买。
产品编号 服务名称
ASB-F0003 ChIP-GLAS-H20K
ASB-F0006 GLAS-20K-chip
ASB-F0009 GLAS-H20K
公司简介

        博奥生物有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心(以下简称“博奥生物”)成立于2000年9月30日,注册资金现为3.765亿元人民币。博奥生物着重以市场为导向、产业化为目标,依靠自主创新,秉持信诺重礼,现已迅速发展成为国际领先的生物高技术公司。
成立以来,以清华大学、中国医学科学院、军事医学科学院和华中科技大学为技术依托,博奥生物致力于为集成医疗(包括预测、预防和个体化医疗)领域开发和提供创新性产品和服务,研制开发出了生物芯片(包括基因、蛋白、细胞芯片和芯片实验室等)及相关仪器设备、试剂耗材、软件数据库等四个系列数十项具有自主知识产权,可以在国际舞台上与其他厂家竟争的产品和服务,多款产品获得了中国食品药品监督管理局(SFDA)《医疗器械注册证》、欧盟CE认证和美国食品药品监督管理局(FDA)安全通关备案等证书,其中激光共焦扫描仪、杂交仪、点样仪、生物芯片基片等多项产品已进入美国、欧洲、澳大利亚、日本和韩国等生命科学主要市场。2005年,美国权威的《时代》周刊连续两次对博奥生物进行了积极报道,指出“博奥生物是一个具有自主研发能力,并能够研制生产出兼具创新性和高性价比产品的公司”。

        截止2005年末,博奥生物总资产达5.41亿元,拥有24,000平方米的研发、生产和运营设施,其中包括临床诊断级微阵列芯片和配套试剂GMP生产车间,硅基、塑料基微流体芯片微加工洁净车间,以及生物芯片相关仪器设备生产车间,先后获得了中国食品药品监督管理局(SFDA)《药品生产企业许可证》、《医疗器械生产企业许可证》、《医疗器械经营企业许可证》和ISO9001、ISO13485质量管理体系认证。目前,博奥生物全资拥有境外独立法人企业2家(博奥生物香港有限公司和美国博奥生物国际有限公司),通过专利技术和现金出资在国内外参控股公司2家(美国Aviva Biosciences公司和深圳微芯生物科技有限责任公司),现有员工400多人。博奥生物将依靠自身优秀的研发、生产、营销和服务团队,凭籍自身国际领先的生物芯片生产、服务技术平台和高标准的质量保证体系,面向“生命科学研究、生物(含食品)安全检测、健康评价与临床诊断、药物开发”等应用领域,继续为广大客户和合作伙伴提供先进的高通量生物芯片技术服务和行业应用整体解决方案。

        博奥生物的飞速发展受到了各方的广泛关注。2002年,博奥生物作为亚洲唯一入选的公司,被美国《财富》杂志评为2002年度“全球最有发展前景的生物技术公司”;2003年,博奥生物位列由国务院发展研究中心主办的《新经济导刊》杂志评选的“中国十大生物芯片企业排行榜”榜首;2004年,《财富》杂志再次撰文指出,“博奥公司已经成为中国第一家进入世界水平的生物技术公司”;2005年,博奥生物成为美国Red Herring杂志评选的“亚洲非上市技术100强公司”中的八家生物技术公司之一; 2006年,博奥生物被英国《自然》杂志评选为全球知名的微阵列产品和服务推荐供应商,微阵列芯片激光共聚焦扫描仪(晶芯® LuxScanTM 10K)和微阵列芯片点样与生产系统(晶芯® SmartArrayerTM 48 和晶芯® SmartArrayerTM 136)被科技部认定为国家重点新产品,同年,博奥生物获得“德勤中国高科技、高成长50强”第一名。2007年,其系统化生物芯片和相关仪器设备的研制及应用项目荣获国家技术发明奖二等奖。
        北京博奥晶典生物技术有限公司(以下简称“博奥晶典”)是博奥生物集团有限公司暨生物芯片北京国家工程研究中心的核心企业。博奥晶典注册成立于2012 年8 月,在北京经济技术开发区、中关村生命科学园和成都市温江区等地拥有生物芯片耗材类和仪器设备类的生产、研发、营销和运营基地,总面积超过3.5 万平方米,员工300 多人,其中博士、硕士100 多人,是智力、科技和资本混合密集型的高新技术企业。

        博奥晶典依托清华大学和博奥生物集团,以自有研发生物芯片技术平台为主,以引进转化吸收各类国际领先技术平台为辅,立足以新一代生物检测技术(芯片、测序、多重PCR、质谱、细胞分检等技术)为核心,向国内外科研、临床诊断、检验检疫、农林畜牧等市场提供仪器设备和配套试剂耗材、科研服务外包、实验整体解决方案等,在基础科学研究、生物农业、畜牧业、新药研发、食品安全和临床医学研究等领域为顾客提供一流的服务和支持。


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