芯片与生物信息学

EST文库分析

基本信息
服务名称:
EST文库分析
英文名称:
EST文库,文库基因注释,差异表达分析,基因功能注释
参考报价:
总点击数:
2894
更新日期:
2010-11-08
服务类别:

服务详情

读取测序峰图(Base calling) 通过分析测序峰图文件,读取DNA碱基序列信息以及各个碱基的测序质量得分。

EST序列质控(Quality control) 屏蔽简单重复序列,载体序列,引物序列,低质量测序部分序列等。

文库基因注释(Gene annotation)将EST文库序列通过合适的blast方法比对到各个标准数据库,从而获取EST到已知基因的对应关系。

基 因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 富集分析是基于统计学检验的case/control高通量分析方法,可用于揭示生物学样本(case相对于control)中被显著激活或显著抑制的功 能。与翔自主开发研制了不同的功能分析数据库,可以提供对GO、KEGG、BioCarta、疾病相关基因、肿瘤相关基因、转录因子结合位点等功能的富集 分析。

基因功能注释(Gene function annotation),通过KOG/COG数据库完成EST序列的功能注释

 
公司简介

发展历史:源自清华大学医学院生物信息学研究所,2006年1月正式注册成立;国内最早的生物信息学专业数据分析公司;拥有自主研发的高通量数据分析分析平台,擅长各种芯片数据和质谱数据的深入分析。
团队成员:公司成员都是高学历的生物信息学人才,主要研发骨干为清华大学、北京大学和军科院的生物信息学博士,并建有自己的专业人才库,已收录200多位专业人才。
合作交流:
跟国内近百家科研单位进行数据分析合作
跟美国SpotFire公司和西班牙Integromics公司展开深入合作,为其提供高通量数据的生物信息学分析方案和专业软件开发


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