罗氏454高通量测序--性能参数，报价/价格，图片

基本信息

服务名称：

罗氏454高通量测序

英文名称：

参考报价：

服务商：

上海博星基因芯片有限责任公司

总点击数：

2688

更新日期：

2011-02-25

服务类别：

测序/合成

服务详情

罗氏454测序系统是最早出现的新一代测序系统，其应用成果在Nature，Science上发表了多篇论文。454系统自推出以来进行了多次升级，最新的GS FLX序列分析仪的配合Titanium系列测序试剂具有更高的测序通量（400Mb每反应），具有更加广泛的灵活性和准确性，并且保持了新一代测序技术中运行速度最快（3-5天）和最高单序列读长（400 bp）的优势，而且单一读长的准确性可以超过99.5%，完整测序结果一致准确性大于99.99%。Titanium系列中的新成员，长距离Paired-End试剂盒更能对长达3-20kb的插入片段进行双端测序，突破了新一代测序技术对重复序列较差的瓶颈。此外，具备完整的软件包是GS FLX的一大特色，其简单易用的图形界面，可以用来进行作图、拼接和扩增产物差异检测等研究。同时GS FLX因为其超高的测序读长，可以和传统的序列分析软件相互接轨，也是其他新一代测序技术所不能实现的。正因为其优异的性能，GS FLX 系统可以广泛应用在全基因组de novo测序和BAC文库重测序、扩增产物重测序、转录组分析、基因调节的研究等基因组学研究中。

特色

Ø 快速、成本低廉、方法简便

Ø 支持各种不同来源的样品：包括基因组DNA，PCR产物

Ø BAC，cDNA，小分子RNA等等

Ø 提供了完整的从样品制备到后续的生物信息学分析解决方案

Ø 为目前遗传分析和功能基因组等热门研究领域的部分热门课题

Ø 提出了全新的应用方案。针对不同客户的不同需求，量身定做不同的测序解决方案

原理

454 GS FLX 基因组测序仪的原理是通过焦磷酸盐测序原理与微流体技术的整合。它是一种新的依赖生物发光进行 DNA 序列分析的技术，在 DNA 聚合酶、 ATP 硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下，将引物上每一个 dNTP 聚合与一次荧光信号释放偶联起来，通过检测荧光的释放和强度，达到实时测定 DNA 序列的目的，此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针，也不需要进行电泳，具有分析结果快速、准确、灵敏度高和自动化的特点。

服务流程

Ø 剪切、连接：基因组DNA“剪切”成300－800个碱基的片断，然后和两个衔接子A、B进行平端连接。A、B 衔接子各自含有20个碱基的PCR 引物序列、20个碱基的测序引物序列和4个碱基的对照序列（TACG），除此之外，B衔接子的5’端还标记有一个生物素基团，供后续的分离合适的测序模板使用

Ø 单链DNA模板的分离

Ø emPCR （emulsion PCR）：仅含有A、B衔接子单链DNA模板和过量的DNA 捕捉珠子退火结合，并被吸附到一种用于PCR反应的油-水混合物的小滴上，以单链的DNA为模板进行PCR扩增，结果得到大量同一序列的DNA链

Ø 测序反应

提供服务

Ø 全基因组测序

（1）多达120 Mb的未知基因组的测序
－生成基因组结构概图
－研究DNA序列的组织，分布和信息
－基因筛查：寻找新基因，定位和功能
－和其他基因组进行比较研究
－识别单碱基突变
－识别突变热点和保守区域
－识别插入或者缺失的基因
－断定基因型和表型之间的相关关系（比如，研究药物抗性的遗传基础）
－基于基因测序变化进行毒性预测
－进行流行病学分析
－了解工业生产菌株和它们的亲代菌株序列上的差异作为进行工业生产菌株开发的遗传基础
－进行宏基因组（metagenomics）研究
－古代化石DNA 测序研究

（2）比较基因组及分子进化分析：序列同源比对、通过相邻物种的比较基因组研究进行进化分析、基因注释、功能分类等

（3）利用配对末端方法（Pair-End Tag）将Contigs拼接成Scaffolds。

Ø 转录组和基因调节研究

（1）基于短Tags，ESTs, ChIP，或者GIS-PET序列的高通量转录组分析，或者miRNA 序列的基因组范围识别，小分子和非编码RNA的测序。
（2）研究DNA的甲基化模式来进行基因调节的研究。

Ø 扩增产物分析

PCR产物的超精细测序（应用于医学研究的重测序）
－在混合的肿瘤样本中识别体细胞突变
－在群体水平上发现高可信度的SNP位点

Ø 信息分析

（1）基本信息分析：图像识别，basecalling，过滤接头序列，检测可能的样品污染。
（2）高级信息分析
A 基因组注释：包括基因组组分分析、基因预测、重复序列注释、Non-coding RNA预测和假基因（Pseudogene）注释等。
B 基因的功能注释及分类: 通过比对软件（Blast系列软件包）与公共数据中序列做同源性联配，在保证严格置信度标准前提下，对基因进行功能注释。最全面数据库的使用，保证所得数据与国际同步，最大限度挖掘基因组信息。

公司简介

关于联合基因
联合基因科技集团于1997年11月发源于复旦大学，由毛裕民教授、谢毅教授带领复旦大学生命科学学院的一批教师和博士、硕士研究生发起组建。由100万起步，迄今已经形成资产超过50亿，拥有30多家企业（包括一家上市公司）的基因技术企业集团。上海博星基因芯片有限公司，是中国成立最早、规模最大的基因芯片研发、生产和经营企业，是联合基因科技集团旗下的专业芯片公司。博星公司于2007年引进全套illumina微珠芯片平台，迄今为止已为国内外上百所高校及科研单位提供了数千张芯片的技术服务。

关于Illumina：
Illumina公司总部位于美国加州圣地亚哥，是NASDAQ上市公司，专精生物芯片技术的产品开发和应用。其核心技术为创新的微珠芯片技术（BeadArray），为基因功能分析的强有力的工具，主要应用于功能基因组学基因表达的研究和SNP基因分型研究。在这项技术的帮助下，Illumina 击败了众多竞争对手，成为人类基因组项目最主要的基因芯片供应商。。Illumina公司通过不断研发全新的技术以及推广世界一流的芯片产品和服务，已在功能基因组研究领域创建了崭新的标准。在美国知名财经杂志《福布斯》今年2月份发布的“2008年成长最快25家美国科技公司”排行榜中，illumina超过谷歌(Google)位居榜首。

网址：www.unitedgene.com
全国免费热线电话：800-720-0130

目前主要的产品和服务有：
人基因表达谱芯片
小鼠基因表达谱芯片
大鼠基因表达谱芯片
水稻基因表达谱芯片
定制表达谱芯片
定制寡核苷酸芯片
芯片相关技术服务

分子生物学的建库、克隆、大规模DNA测序、表达基因差异显示等技术服务
临床检测芯片
RNA抽提试剂Unizol
SNP分析

我们的服务优势
国内规模最大的基因开发研究企业——联合基因科技（集团）有限公司和国际知名学府——复旦大学共同投资兴办的中国最早运用大规模基因组研究成果进行技术服务及产品开发的生物技术企业之一。
1. 上海联众基因科技研究院 1997年开始文库构建、SSH和测序服务，建有复旦-贝克曼超高通量SNP检测示范中心。
2. 上海博星基因芯片有限公司 2000年开始基因芯片服务