芯片与生物信息学

基因芯片-基因组层次服务

基本信息
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基因芯片-基因组层次服务
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3973
更新日期:
2015-08-19
服务类别:

服务详情
Illumina Human SNP 分型芯片服务
 
Illumina全基因组分型芯片采用Infinium技术,该技术无需PCR反应,不依赖限制性内切酶,在SNP位点的选择上可以完全根据基因组情况来选择,芯片反应通过等位基因特异性延伸来完成,保证了高质量的实验数据。SNP是迄今为止分布最为广泛、存在数量最多的一种遗传多态性。SNP的研究将帮助我们寻找新的遗传病的致病基因或易感基因,认识人种、人群、个体间的遗传差异,疾病与个体差异的关系,以及个体差异对药物的耐药性存在的不同的反应能力。
 
芯片名称: Human omni-1 quad beadchip
芯片信息: Human omni-1 quad 芯片数据来自于人类千人基因组计划测序结果。其中包含了超过114 万个探针信息,可以在一张芯片上平行进行4 个样本的检测。该款芯片包含针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化(CNV), 及其他高价值的基因组区基因组区域域设计探针。
 
芯片名称:Human omniexpress-12 beadchip
芯片信息:含盖人类基因组计划HapMap三个阶段研究的数据,针对基因SNPs,标签SNPs,拷贝数变化(CNV),及其他高价值的基因组区域设计探针.共700,000多个位点,每张芯片可同时检测12个样本。在r2 > 0.8 前提下,在CEU,JPT+CHB,YRI等人种中基因组覆盖率分别为:0.91,0.91,0.68。CNV区域平均间隔4.0kb。
 
芯片名称:Human omni-zhonghua-8 beadchip
芯片信息:此芯片是一款专为中国人设计的全基因组SNP基因分型芯片,每张芯片做8个样品,芯片覆盖了在中国人群体中发现的常有和稀有变异,适用于全基因组关联研究(GWAS)。经优化的90万个标签SNP信息来自HapMap所有三个阶段及千人基因组计划(1kGP)。并经策略性选择,可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。
 
芯片名称:Infinium Human Exome BeadChip
芯片信息:Human Exome BeadChip芯片前所未有地覆盖了推定的功能性外显子变异,这些变异精选自12,000多个个体的外显子组和全基因组序列。外显子内容包含了> 240,000个标志物,它们代表了不同群体—包括欧洲、非洲、中国和西班牙个体—以及多种常见病,如II型糖尿病、癌症、代谢及精神疾病。
 
芯片名称:CytoSNP-12 BeadChip
芯片信息:CytoSNP-12 BeadChip芯片,包含30万个和疾病相关的遗传标。数据来源于Hapmap  I和II。
 
芯片名称:Omni2.5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni2.5-Quad BeadChip芯片,包含250万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔1.2kb,MAF>2.5%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。
 
芯片名称:Omni5-Quad BeadChip
芯片信息:Omni5-Quad BeadChip芯片,包含500万个SNP探针及CNV探针。用于基因分型和全基因组CNV分析,平均间隔0.6kb,MAF>1%。数据来源于Hapmap  I到III和1000 Genomes。
 
技术路线
 
生物信息学分析
 
样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品。
2)样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。DNA样品请提供1μg以上的基因组DNA。
3)样品质量:DNA无明显降解,OD260/280值在1.7~1.9之间,浓度≥50ng/μl。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)用液氮速冻后,-80℃保存。DNA样品可溶于的超纯水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃长期保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。DNA样本放离心管或者PCR板中,密封后,冰袋运输。
 
 
 
样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品。
2)样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。DNA样品请提供1μg以上的基因组DNA。
3)样品质量:DNA无明显降解,OD260/280值在1.7~1.9之间,浓度≥50ng/μl。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)用液氮速冻后,-80℃保存。DNA样品可溶于的超纯水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃长期保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。DNA样本放离心管或者PCR板中,密封后,冰袋运输。
公司简介
晶能生物技术(上海)有限公司(简称“晶能生物”)成立于2010年2月。自成立以来,高速发展,成为中国生物技术服务行业领先地位的公司。
晶能生物专注健康医疗产品和生命科学领域科技服务,抓住了中国健康医疗产业的巨大机遇和生命科学市场的快速成长势头,形成了以产品研发和科技服务为核心,涉足生命科学,临床疾病、人类健康等领域的产业化服务体系,在产品研发、人才建设、市场营销、销售渠道、专业服务等方面形成极具竞争优势的中国知名的高新技术企业。
晶能生物注重产品开发,成立创新健康医疗研究中心,资深的专家团队、国际先进的仪器设备,完善的管理和研发体系,让中心成为一个充满激情、力量雄厚、极具发展潜力的研发机构。
晶能生物通过ISO9001:2008质量体系认证, 并率先成为illumine CsPro和BioNano官方认证服务商。主要技术平台有BioNano单分子光学图谱平台、Illumina-Hiseq3000高通量测序平台、Illumina-Hiseq2500高通量测序平台、Illumina-Hiseq1500高通量测序平台、Illumina-Miseq高通量测序平台,Illumina-iScan基因芯片平台、Illumina-ECO Real Time PCR平台、Sequenome-质谱分析平台、曙光高性能服务器平台以及各种配套设备,完成项目达到近2000个,完成专利达到近10项,合作客户发表文章影响因子超过400。晶能生物已取得国内二代测序,基因芯片等市场的竞争优势,成为这个行业的领先者。
晶能生物奉行客户第一、共享快乐、共同成长、持续发展的原则,始终怀着感恩的心态,努力做一个让社会、客户、员工和股东满意的企业,并成为提供健康医疗产品和科技服务的领导性公司。

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