基因芯片数据分析服务-生物信息学分析服务
基本信息
服务名称：
基因芯片数据分析服务-生物信息学分析服务
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4199
更新日期：
2015-08-19
服务类别：
服务详情
1．表达谱分析：通过芯片杂交信号的荧光强弱来得到mRNA，miRNA的表达量或者CpG位点的甲基化程度，利用统计学方法来筛选差异位点，最后借助功能分析来寻找可能的生物学解释。
A：基本分析流程
B：部分结果展示
Box plot 图：是利用数据中的五个统计量：最小值、第一四分位数（25%）、中位数（50%）、第三四分位数（75%）和最大值来描述数据的一种方法，它也可以粗略地看出数据是否具有有对称性，分布的分散程度等信息。
Pca 图：通过降维度的方式来看样本间的相似程度，不同的颜色表示不同分组的样本。样本间距离越近表示样本基因的表达趋势约接近。
火山图：两条绿色直线对应fold change 2倍差异，绿色横线对应P=0.05，红色是差异基因区域。
非监督聚类图：纵列表示样本横列表示基因，信号值的强度用色阶表示，进化树表示基因或者样本的相似程度。
自组织映射聚类SOM 分析：将变化趋势一致的基因聚类，横坐标是不同阶段，每条线表示一个基因的表达趋势。
Go 关系图
Pathway 图
网络关系图
2．家系连锁分析：适用于单基因病研究，连锁分析通过分析减数分裂过程中染色体重组的情况，判断snp位点与疾病位点之间是否连锁，以及连锁的紧密程度（lod score）。然后利用阳性区域推断单倍型来明确家系中DNA的传递关系，找到交换发生的位置进一步缩小候选基因的范围。
A：基本分析流程
B：部分结果展示
Lod plot 图：横坐标是染色体位置纵坐标是lod score值
单倍型图：可以从图中看到病人共享相同的单倍型
3．GWAS分析：针对复杂疾病研究，通过大样本量和全基因组的tagSNP基因分型，借助统计学方法来控制人群分层等干扰因素的影响，进而识别和疾病显著关联的SNP位点，找寻潜在的易感基因。
A：基本分析流程
B：部分结果展示
利用PCA分析人群分层情况剔除异常样本
Q-Q plot反应样本群的分层情况，越接近1人群分层情况影响越小
Manhattan plot反映统计检验后p值在基因组上的分布情况
显著位点区域放大图
LD plot 根据LD连锁关系得到block区域,将多SNP位点与候选区域进行关联展示
4．CNV分析：针对疾病研究，通过包含CNV探针的SNP芯片来检测拷贝数变异，利用统计学方法来优化变异区域的边界，进而识别和研究关联的CNV区域，找寻潜在的易感基因。
A：基本分析流程
B：部分结果展示
CNV区域的识别
CNV区域的染色体分布
CNVR区域的合并
疾病相关的CNV区域
公司简介
晶能生物技术（上海）有限公司（简称“晶能生物”）成立于2010年2月。自成立以来，高速发展，成为中国生物技术服务行业领先地位的公司。
晶能生物专注健康医疗产品和生命科学领域科技服务，抓住了中国健康医疗产业的巨大机遇和生命科学市场的快速成长势头，形成了以产品研发和科技服务为核心，涉足生命科学，临床疾病、人类健康等领域的产业化服务体系，在产品研发、人才建设、市场营销、销售渠道、专业服务等方面形成极具竞争优势的中国知名的高新技术企业。
晶能生物注重产品开发，成立创新健康医疗研究中心，资深的专家团队、国际先进的仪器设备，完善的管理和研发体系，让中心成为一个充满激情、力量雄厚、极具发展潜力的研发机构。
晶能生物通过ISO9001:2008质量体系认证, 并率先成为illumine CsPro和BioNano官方认证服务商。主要技术平台有BioNano单分子光学图谱平台、Illumina-Hiseq3000高通量测序平台、Illumina-Hiseq2500高通量测序平台、Illumina-Hiseq1500高通量测序平台、Illumina-Miseq高通量测序平台，Illumina-iScan基因芯片平台、Illumina-ECO Real Time PCR平台、Sequenome-质谱分析平台、曙光高性能服务器平台以及各种配套设备，完成项目达到近2000个，完成专利达到近10项，合作客户发表文章影响因子超过400。晶能生物已取得国内二代测序，基因芯片等市场的竞争优势，成为这个行业的领先者。
晶能生物奉行客户第一、共享快乐、共同成长、持续发展的原则，始终怀着感恩的心态，努力做一个让社会、客户、员工和股东满意的企业，并成为提供健康医疗产品和科技服务的领导性公司。
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