芯片与生物信息学

基因芯片-Illumina人DNA甲基化芯片服务

基本信息
服务名称:
基因芯片-Illumina人DNA甲基化芯片服务
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3732
更新日期:
2015-08-19
服务类别:

服务详情
DNA甲基化在基因表达调控中扮演着重要的角色(人类的甲基化只发生在CpG位点,大多数CpG岛位于启动子和第一外显子区域,启动子区域的甲基化抑制基因的表达),在正常的细胞发育和维持组织稳定性方面有着重要的作用机制。人类的许多疾病(包括癌症)都是由于异常的甲基化引起的。应用芯片这个高通量手段检测基因组的甲基化,会大大加速甲基化研究发展,提升研究效率,并很有可能发展成人类疾病诊断、预防和治疗的有效工具,为此Illumina推出Illumina DNA甲基化芯片。
 
芯片名称:Illumina Infinium Human Methylation450 BeadChip
芯片信息:每张芯片可平行进行12个样本的检测,包含了450,000多个甲基化位点,全面覆盖了96%的CpG岛,并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤(多种癌症)组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和已通过GWAS的疾病相关区域的位点,同时覆盖了Human Methylation27 BeadChip的90%的位点。是唯一一款适合表观基因组全关联分析研究的全基因组DNA甲基化芯片。
 
技术路线
 
生物信息学分析
 
样品要求
1)样品类型:细胞、新鲜组织或DNA样品。
2)样品量:细胞样品请提供至少5×106个细胞,组织样品请提供至少100mg的组织块或切片。DNA样品请提供2μg以上的基因组DNA。
3)样品质量:DNA无明显降解,OD260/280值在1.7~1.9之间,浓度≥ 50ng/μl。
4)样品保存:细胞样品或新鲜组织块(切成~50mg的小块)用液氮速冻后,-80℃保存。DNA样品可溶于的超纯水或TE(PH8.0)中,-20℃短期保存或者-80℃长期保存。样品保存期间避免反复冻融。
5)样品运输:细胞或组织样品置于1.5 ml管中,封口膜封好,干冰运输。DNA样本放离心管或者PCR板中,密封后,冰袋运输。
 
参考文献
[1]  Harris RA, Nagy-Szakal D, Pedersen N, Opekun A, Bronsky J, Munkholm P, Jespersgaard C, Andersen P, Melegh B, Ferry G, Jess T, KellermayerR.Genome-wide peripheral blood leukocyte DNA methylation microarrays identified a single association with inflammatory bowel diseases.Inflamm Bowel Dis. 2012 Dec;18(12):2334-41. doi: 10.1002/ibd.22956. Epub 2012 Mar 29.
[2]  Kulis M, Heath S, Bibikova M, et al.  Epigenomic analysis detects widespread gene-body DNA hypomethylation in chronic lymphocytic leukemia.Nat Genet. 2012 Oct 14;44(11):1236-42. doi: 10.1038/ng.2443. Epub 2012 Oct 14.
公司简介
晶能生物技术(上海)有限公司(简称“晶能生物”)成立于2010年2月。自成立以来,高速发展,成为中国生物技术服务行业领先地位的公司。
晶能生物专注健康医疗产品和生命科学领域科技服务,抓住了中国健康医疗产业的巨大机遇和生命科学市场的快速成长势头,形成了以产品研发和科技服务为核心,涉足生命科学,临床疾病、人类健康等领域的产业化服务体系,在产品研发、人才建设、市场营销、销售渠道、专业服务等方面形成极具竞争优势的中国知名的高新技术企业。
晶能生物注重产品开发,成立创新健康医疗研究中心,资深的专家团队、国际先进的仪器设备,完善的管理和研发体系,让中心成为一个充满激情、力量雄厚、极具发展潜力的研发机构。
晶能生物通过ISO9001:2008质量体系认证, 并率先成为illumine CsPro和BioNano官方认证服务商。主要技术平台有BioNano单分子光学图谱平台、Illumina-Hiseq3000高通量测序平台、Illumina-Hiseq2500高通量测序平台、Illumina-Hiseq1500高通量测序平台、Illumina-Miseq高通量测序平台,Illumina-iScan基因芯片平台、Illumina-ECO Real Time PCR平台、Sequenome-质谱分析平台、曙光高性能服务器平台以及各种配套设备,完成项目达到近2000个,完成专利达到近10项,合作客户发表文章影响因子超过400。晶能生物已取得国内二代测序,基因芯片等市场的竞争优势,成为这个行业的领先者。
晶能生物奉行客户第一、共享快乐、共同成长、持续发展的原则,始终怀着感恩的心态,努力做一个让社会、客户、员工和股东满意的企业,并成为提供健康医疗产品和科技服务的领导性公司。

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