全质粒测序
数据质控:去除接头污染和低质量数据;
与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度;
序列拼接组装,交付质粒序列fasta格式文件。
注:以下情况可能会有拼接结果不好的风险:a. 质粒存在重复序列、高GC\AT结构;b. 质粒不纯(相似度太高的质粒无法通过本方法区分开)。
案例展示:
图1.测序成环质粒图
图2.质粒序列FASTA格式文件
送样要求:
纯菌:新鲜菌液≥200 μL,穿刺菌,冰袋运输;
质粒:浓度≥50 ng/μL,体积 ≥20 μL,主带明显、无降解无污染,务必用灭菌的双蒸水溶解;
信息单详细填写载体名称、质粒大小及抗性,擎科提供Amp,Kana两种抗生素。
寄样地址:(请联系当地销售经理寄送)
江苏省南京市江宁区乾德路9号大树科技2号楼五楼
高通量测序组(收) 13851793730
寄件须知:
冰袋保存寄送,建议选择顺丰快递,寄样时需要将《擎科生物高通量测序样品信息单-全质粒测序》(长按识别下方二维码)打印出来随样本一起寄送。
北京擎科生物科技股份有限公司(Beijing Tsingke Biotech Co., Ltd.)是一家自主全产业链的基因合成平台型企业,业务范围涵盖合成基因组学产品及服务、生命科学原料及设备、生物制造CXO三大方向。
企业总部位于北京,运营实体和实验室遍布全国,总运营面积超70,000 m²。致力于为全球从事生命科学研究的科研人员及企事业单位提供高质量的生物技术服务和产品,业务覆盖全国并延伸至美洲、欧洲等海外地区,拥有快速响应客户需求的能力,为全球近20万用户提供服务与产品。
[使命]生物科技 · 让世界更美好
[愿景]世界伟大的基因工厂
[核心价值观]品质 创新 奋斗 共赢
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