Illumina公司的Solexa测序技术是一次运行就能产生数百亿到数千亿高质量碱基的革命性化学方法，这种技术的成本不足毛细管测序千分之一。Solexa测序技术运用了微阵列技术和专有的可逆终止子技术，可快速而准确的进行大规模测序。

技术特点

1. 高质量的测序数据

在每个流动槽中对数百亿到数千亿碱基机型准确的碱基识别。

对读测序时，模板可以重新生成，在两次读取间获得相同准确度。

严格的功能检测确保检测稳定性和重复性。

2. 应用广泛

SNP和结构变异检测、从头测序组装、转录组测序、甲基化检测等。

即使最小的实验室也能对物种基因组进行测序。

已经在基因组研究中得到广泛应用，成为二代测序主流平台。

3． 高效的样本制备

高速自动化工作流程

低样品量要求

可在不到一周的时间内生成数据

4. 灵活的平台

稳定的Solexa测序化学反应支持多种读取长度

研究人员可量身定制每次所需读长

数据整体质量得以提高

检测原理

Solexa测序技术可以生成高密度、海量平行测序反应，可对每个流动槽中成百上千万的模板进行单端或对读测序。全自动的illumina簇生成工作站在恒温条件下在流动槽表面扩增生产DNA簇，每个簇含有单个模板分子的500-1000克隆拷贝。用全自动基因分析仪在流动槽表面对生成的高密度序列模板进行测序。采用专有的荧光标记的可逆终止核苷酸，可对样本边合成边测序。对读测序时，完成首次读取后，DNA簇进行原位改良，在生成对读所用的模板。然后应用第二个测序引物对同一DNA簇测序，生成第二次数据。

应用领域

SNP和结构变异检测、从头测序组装、转录组测序、甲基化检测等

基因组测序

转录组测序

小分子RNA测序

ChIP-Seq

甲基化检测

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