染色质免疫共沉淀芯片（ChIP-chip）技术服务
 

ChIP-chip（也被称为ChIP-on-chip）将染色质免疫共沉淀技术（ChIP）及与芯片方法（chip）结合，是一种研究体内DNA与蛋白相互作用的高通量技术。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质－DNA复合物，并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段，然后通过免疫学方法沉淀此复合体，特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，通过对目的片断的纯化与检测，从而获得蛋白质与DNA相互作用的信息。ChIP-chip技术不仅可以用于研究蛋白因子与DNA的相互作用，还用可用于研究不同类型的组蛋白修饰与基因表达调控的关系等；ChIP-chip技术也已在一些至关重要的生命过程中为我们提供了重要的线索，包括细胞增殖、细胞分化、癌症发生、细胞周期、细胞凋亡以及神经生成等过程。
*  研究组蛋白的甲基化、乙酰化或磷酸化等修饰形式在所有基因启动子部位的结合状态
*  研究转录因子在所有基因启动子部位的结合状态（寻找转录因子调控的下游靶基因）

Arraystar 4x180K启动子芯片

    Arraystar 启动子芯片是为研究非编码RNA启动子区域的表观遗传修饰和转录因子结合情况而设计的产品。Arraystar分别针对mRNA，LncRNA，miRNA的启动子区域设计了不同的180K芯片产品，可以满足不同客户的需求。180 K的人、小鼠甲基化芯片，基因启动子的覆盖范围近2kb，是一款高品质高性价比的启动子芯片产品。

Arraystar RefSeq 启动子芯片产品列表

 
Arraystar  ncRNA 启动子芯片产品列表

Arraystar 癌症相关甲基化芯片
Arraystar 4 x 180K Block芯片
    Arraystar 4 x 180K Block芯片是专门为研究癌症相关的block区域而设计的产品，覆盖位于7088个block区域中的2554个蛋白编码基因、8481个长链非编码RNA、463个miRNA genes。通过这款芯片可以检测block区域中的基因和LncRNA的甲基化变化，组蛋白修饰以及转录因子结合情况。此外，结合Arraystar Block表达谱芯片，还可以了解甲基化变化与基因表达水平间的联系。

 Arraystar 4 x 180K DMR芯片

    Arraystar 4 x 180K DMR芯片是专门为研究癌症相关的差异甲基化区域而设计的产品，覆盖12113个与癌症、组织及细胞分化相关的small DMRs, 以及11380个与这些small DMRs相邻的CpG岛及CpG岛岸。通过这款芯片不但可以检测癌症相关的甲基化变化，还可以了解引起这种甲基化变化的CpG岛边界漂移模式，从而更加全面直观的解析癌症甲基化组。

康成生物ChIP-chip服务技术优势

● 一站式服务：客户只需要提供保存完好的组织或细胞标本，康成的芯片技术服务人员就可为您完成全部实验操作（下图）和数据分析流程，并提供完整的实验报告。

● 严格的质控体系：康成生物在CHIP-chip每个关键步骤都加入了质控实验（下图）。这些QC数据能够评估每个步骤的实验质量。如果达不到标准，我们会重复实验步骤或者优化实验体系，使得每个样品都能够达到质控标准。

图释：ChIP-chip技术服务流程和质控。

● 丰富的生物信息学分析：除了严谨，可靠的实验体系，康成生物还有强大的生物信息学团队，为客户提供paper级的图表和深入的数据分析服务

康成生物ChIP-chip芯片技术服务主要实验流程
1. 样品交联
Formaldehyde处理细胞，交联核酸与DNA结合蛋白
2. 超声打断染色质
裂解细胞，并以超声波将染色质破碎成400－500bp片断
3. 染色质免疫共沉淀
取步骤2所得片断与ChIP特异抗体结合进行免疫共沉淀，利用免疫磁珠法富集抗体复合物后解交联释放DNA片段，并进行纯化；取部分步骤2所得片断作对照（Input）不进行ChIP实验，但也解交联并纯化
4. 线性扩增ChIP及Input DNA 片段
    使用Sigma WGA Kit对两份DNA样品（ChIP 与 Input）进行扩增。该步骤使检测的的灵敏度得到大幅度提升，用微量的检测样品就能得到精确的检测结果
5. 荧光标记
    分别对ChIP-DNA（Cy5）以及Input-DNA(Cy3)进行荧光标记
6. 芯片杂交
    混合标记后的样本后，ChIP-chip芯片杂交，清洗
7. 图像采集和数据分析
    使用芯片扫描仪扫描芯片的荧光强度，并将实验结果转换成数值型数据保存，使用专业商用分析软件对原始数据进行分析运算
8. 提供实验报告 包括详细的实验方法和芯片实验数据和图表
    Scanning Image: Cy3、Cy5荧光扫描图像
    Raw Data：探针的荧光信号强度原始数据
    Probe Report：包括每个探针的log2(ChIP/Input)，此值代表每个探针在ChIP DNA和input DNA中的相对富集强度
    Peaks Report：由专业商用软件计算出探针相对强度在统计学意义上显著的Peaks，代表可能的蛋白结合区。Peaks report包含每个Peaks的基因组位置信息，以及Peaks周围基因的相关信息
    Summary Report: 提供多样本之间Peaks区域的比较以及汇总以提供参考

详细染色质免疫共沉淀芯片技术服务介绍请访问：http://www.kangchen.com.cn/service/serviceMain.asp?id=78

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上海康成生物工程有限公司自2002年起专注于生物科研技术服务，是国内最早一批专业提供生命科学前沿研究技术服务的高科技企业。为进一步拓展在医学科研服务领域业务的深度和广度，向多谱领域发展，重塑品牌 Aksomics（数谱生物）。Aksomics全面整合公司在非编码RNA（lncRNA、circRNA、small RNA等）、表观遗传学、蛋白组学等检测方向的核心技术，依靠自身优秀的研发、技术、营销和服务团队，凭借国际领先的技术平台和高标准的质控体系，形成了涵盖表观基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学等各个研究领域的一站式技术平台。

【表观基因组学】 DNA甲基化芯片、DNA羟甲基化芯片、染色质免疫共沉淀芯片、DNA甲基化测序、DNA羟甲基化测序、染色质免疫共沉淀测序、MeDIP-PCR、hMeDIP-PCR、ChIP-PCR等

【转录组学】LncRNA芯片、LncPath™芯片、环状RNA芯片、T-UCR芯片、microRNA芯片、piRNA芯片、全基因组表达谱芯片、RNA测序、RNA m6A甲基化测序、small RNAs测序系列（microRNA测序、tRF&tiRNA测序、snoRNA测序、piRNA测序等）、LC-MS tRNA修饰检测、 nrStar™ ncRNA PCR芯片（tRF&tiRNA，tRNA，snoRNA，Functional LncRNA）、miRStar™癌症特异性microRNA PCR芯片、NuRNATM mRNA PCR芯片、功能分类PCR芯片、LncRNA实时定量PCR、环状RNA实时定量PCR、tRF&tiRNA实时定量PCR、microRNA实时定量PCR、mRNA实时定量PCR

【蛋白组学平台】TMT标记定量蛋白组学服务、Lable-free定量蛋白组学服务、磷酸化修饰蛋白组学服务、泛素化修饰蛋白组学服务、N-糖基化修饰蛋白组学服务、乙酰化修饰蛋白组学服务、蛋白-蛋白相互作用组学

【代谢组学】靶向代谢组学、非靶向代谢组学

【外泌体组学】外泌体转录组学、外泌体蛋白质组学、外泌体代谢组学
康成生物为Agilent、Arraystar、Exiqon、Illumina、Qiagen、Thermo Fisher等国际知名品牌提供技术服务。康成客户采用各类技术服务发表的SCI论文已超560篇。康成生物将持续聚焦生命科学发展的挑战，提供有竞争力的产品和服务，持续为客户创造最大价值。

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