一、测序策略及技术路线

采用Agilent 最新的捕获试剂盒进行序列捕获。

技术方法和路线：采用Agilent 提供的eArray 在线设计软件设计探针--定制Agilent sure select kit---建库及杂交—cluster 制备—GA 测序—基本数据处理—生物信息分析

1. 样品检测

1) NanoDrop 2000 分光光度计

2) 琼脂糖电泳

3) Agilent2100（可选）

2. 文库制备

采用液相杂交技术：Agilent Sure-Select™液相杂交系统

基因组DNA 的随机打断

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DNA 片段的末端修复和接头的连接

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PCR 扩增文库

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液相探针杂交捕获目的片段

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PCR扩增捕获的DNA片段

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捕获效率的检测

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测序文库的检测

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Genome AnalyzerⅡx测序

3. 上机测序

GAIIx测序，100PE， 每个样本产出数据不低于400M

4. 生物信息分析

a) 原始数据产出统计；

b) 基因组单碱基深度及覆盖度分析；

c) 一致序列组装

d) SNP检测及其在基因组的分布

二、 样品要求

1. 样品总量：每次外显子捕获需要大于15μg的样品，为保证实验质量及延续性，请一次性提供至少30μg样品；

2. 样品纯度：OD260/280值在1.8～2.0 之间；

3. 样品浓度：不低于200ng/ul；

4. 样品保存：选择酒精、TE buffer或超纯水一种，请在样品信息单中注明；

5. 样品运输：样品请置于1.5 ml管中，做好标记，使用封口膜封好，并同《样品信息单》一起放到塑料样品袋中封口。建议使用干冰或冰袋运输，并选择较快的运输方式。

三、完成时间及标准

1. 客户提供待测基因组样本和感兴趣的基因区域列表（要求有参考基因组序列），我方完成探针定制、杂交、测序和生物信息分析整套流程。探针定制成功后3个月完成。

2. 由客户进行探针设计和定制，交给我方进行文库构建、杂交及测序分析工作。2个月完成。

四、 价格

说明

1. 因Agilent芯片定制的最小包装为10RXN/kit，因此，样品数不足10的整数倍的，按照10的整数倍计算探针定制费用。（例：11个样品按照20个样品计费。

若需更多信息请与我们联系

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北京康普森生物技术有限公司自2011年成立以来，深耕育种行业，始终将前沿生物技术的产业转化与中国现代种业创新作为企业之责任与担当。利用领先的基因组技术结合信息技术改良开发多物种的新性状，助力育种研发与生产过程的自动化、集成化、数字化和智能化。

自成立以来，康普森坚持自主研发适合中国种业的育种产品，构建了从技术、设施到产品、服务的育种4.0产业化应用体系。提供基于新型农业基因组技术的动植物分子育种、特色农业基因服务以及现代化农业生产、品牌建设整体解决方案。