LncRNA芯片服务
长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA) 指的是长度在200-100000 nt之间的RNA分子，它们不编码蛋白，但参与细胞内多种过程调控。人们对lncRNA的认识还处在初级阶段，lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”，是RNA聚合酶II转录的副产物，不具有生物学功能。然而，近年来的研究表明，lncRNA参与了X染色体沉默、基因组印记以及染色质修饰、转录激活、转录干扰、核内运输等多种重要的调控过程，与人类疾病的发生、发展和防治都有着密切的关系。lncRNA的种类远远超过编码RNA，哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA（相应的蛋白编码RNA的比例是1%-5%）。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。
lncRNA研究的重要一步是发现与特定疾病相关的lncRNA。传统的lncRNA筛选方法（SELEX等）效率低下，假阳性率高。而基因芯片具有覆盖全面、高效、准确的特点，因此用基因芯片来筛选lncRNA是一种准确快捷的方法。
lncRNA芯片产品
| 人 Human |
小鼠 Mouse |
大鼠 Rat |
拟南芥 Arabidopsis |
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| 格式 | 4×180K | 4×180K | 8×60K | 4×180K |
| lncRNA 数目 |
78243条 | 51302条 | 9984条 | 30105条 |
| mRNA 数目 |
32776条 | 39430条 | 30367条 | 43603条 |
| lncRNA 数据库 |
NONCODE.V4, Gencode v18, Ensembl Release 73, Refseq-release 62, fRNAdb.v3.4, lncRNAdb, UCSC lincRNAs Transcripts, UCSC lincRNAs Transcripts, Broad Institute, Human Body Map lincRNAs and TUCP catalog, Ultra- conserved region encoding LncRNAs (UCR) | NONCODE v3, Ensembl. Release.70, Refseq-release 62, lncRNAdb, ncrna.org | State Key Lab of Space Medicine Fundamentals and Applications, Ensembl. Release.73, Refseq-release 62, Ncrna.org, Lncrnadb | TAIR10, Plncdb, Refseq-release 62, Unigene build 74, Ncrna.org, Lncrnadb |
| mRNA 数据库 |
RefSeq Build 50, Ensemble Release 52, Unigene Build 216, GenBank (April 2009) | RefSeq Build 37, Ensembl Release 55, Unigene Build 176, GenBank (April 2009), RIKEN 3 | RefSeq Build 36.2, Ensembl Release 55, Unigene Build 177, GenBank (January 2009) | RefSeq (Release 30) Jul 2008, UniGene (Build 67) May 2008, TAIR 8 cdna, Apr 2008, TIGR (Release 13) Jun 2006, TIGR Plant Transcript Assemblies (Release 2) Jun 2006，ATHI, Jan 2004 |
技术特点：
1）目前市面上探针密度最高的lncRNA芯片产品；
2）芯片采用Agilent eArray平台设计，使用Agilent SurePrint技术合成，技术重复性高于99%；
3）覆盖主流数据库所有lncRNA，可同时检测lncRNA和mRNA，并挖掘两者之间的关联；
4）检出率高：随机引物扩增方式，可同时扩增带Ploy-A和不带Poly-A的lncRNA，确保更多的 lncRNA被检测出来；
5）提供完整lncRNA芯片数据分析解决方案。
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详细地址：
上海市松江区新松江路926弄开元新都会所3楼
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qq：
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联系电话：
021-54038325
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| Email： |
