测序/合成

动植物基因组重测序

基本信息
服务名称：
动植物基因组重测序
英文名称：
参考报价：
服务商：
上海派森诺生物科技有限公司
总点击数：
732
更新日期：
2013-09-03
服务类别：
测序/合成
服务详情
动植物基因组重测序
简介：基因组重测序是对已知基因组序列物种的个体进行基因组测序，并在此基础上对个体或群体进行比较基因组学分析。通过全基因组重测序可以找到大量的单核苷酸多态性位点（SNPs）、拷贝数变异（Copy Number Variation，CNV）、插入缺失（InDel）、结构变异（Structure Variation，SV）等变异信息，广泛应用于群体遗传学、临床医药、动植物分子育种等众多领域。

 

一、技术路线

  

推荐平台：Illumina HiSeq 2000、Illumina MiSeq

 

 

二、信息分析

1.原始数据整理、过滤及质量评估

 

2.基因组序列拼装与分析：

 与参考基因组比对

 SNPs和InDel检测及在基因组的分布

 CNV和SV检测及在基因组的分布

 包含变异基因的KOG和GO富集分析

 包含变异基因的代谢途径分析（KEGG pathway）

  

3.根据客户需求进行个性化分析

 

 

三、送样要求

1、 DNA样品：浓度≥100 ng/μl，总量≥50 μg，OD260/280值应在1.8-2.0之间，电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整，主带应在100 kb以上。若样品中有多糖、糖蛋白的残留， 对打断DNA样品带来非常大的困难，且很难去除，因此特别要求所提供的样品一定要将多糖或糖蛋白去除干净。
  

2、 动物样品：对于一般物种应挑选肝脏、肾脏、血液等组织取样，对于珍贵物种请提供耳样、毛发（带毛根）等脂肪含量较少的组织进行取样。为了减少个体差异对后续拼接产生的影响，尽量从同一个个体中取样。若物种体积较小，从一个个体中提取的DNA量不能满足测序实验所需，在保证量的前提下，应尽量减少采样个体的数量。  

 

3、 植物样品：  植物材料应尽量选取植物组织幼嫩部位。  

 

四、派森诺优势

Illumina HiSeq 2000测序通量可达600G，适合全基因组测序。80×以上的测序深度，可以保证数据的准确以及SNP的发现。Illumina MiSeq的速度更快，但相对来说成本会较高。

 

派森诺生物拥有多个高端测序平台，根据合作伙伴的实际需求，提供高性价比的动植物基因组重测序。 

公司简介

        上海派森诺生物科技有限公司（以下简称“派森诺生物”）成立于2011年4月，公司总部位于上海市徐汇区，是在已有DNA一代测序合成平台基础上，以上海交通大学等海内外高等学校和科研院所的专家教授团队为技术依托，吸纳了多名基因组学和生物信息学高级专业技术人员加盟组成的高科技生物技术公司。

公司之所以取名派森诺生物（Personalbio）是这样考虑的：首先，人类基因组计划实施和完成，全面开启了生命科学新纪元，其正带动着生物科学研究和应用进入个性化时代；其次，测序技术的飞速发展，以测序中心独揽天下的局面也将被以实验室为单位个性化形式所打破和取代。另外，由于生物种类和客户需求目标的多样性，要求有针对性、个性化的专业服务。
派森诺生物紧紧跟踪全球测序技术发展步伐，2011年率先引进了亚太区第一台罗氏升级版测序平台（Roche 454 FLX+ system）和中国第一台Illumina新一代个人化测序平台（Illumina MiSeqTM），目前拥有Illumina HiSeqTM 2000、Illumina MiSeqTM和Roche 454 FLX+三大高通量测序平台，确保了对不同类型、不同物种的测序需要。
派森诺生物拥有一支实力雄厚的序列测定和信息分析团队，在为合作伙伴提供标准化信息分析服务的基础上，将根据客户需要提供个性化的数据分析与培训。派森诺生物承诺，将为广大合作伙伴提供三大免费服务：免费设计科学合理的实验方案、免费提供常规生物信息分析和免费修改润色英文文稿。
派森诺生物始终以“解析序列，诠释生命”作为企业理念，秉承“立足客户需要，满足个性需求”的服务宗旨，专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、RNA测序、简化基因组及外显子捕获等技术服务。
目前公司合作伙伴遍布全国，包括中国科学院、中国农业科学院、上海交通大学、华东理工大学、内蒙古农业大学、南京大学、瑞金医院、新华医院、国家海洋局第一海洋研究所、华中农业大学、华南农业大学、温州医学院、上海海洋大学、山东农业大学、重庆市畜牧科学院、扬州大学等，已经完成和正在进行多项国家和省市重大或重点科研项目，受到合作伙伴的认同和好评。
售后服务
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