测序/合成

微生物基因组重测序

基本信息
服务名称:
微生物基因组重测序
英文名称:
参考报价:
总点击数:
766
更新日期:
2013-09-03
服务类别:

服务详情
微生物基因组重测序
简介:全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序,并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。. 重测序能够检测全基因组的罕见变异,可以获得大量的单核苷酸多态性(SNP)信息、序列的插入缺失位点信息,还可以检测到多种结构变异(SV)和拷贝数变化(CNV)。
 
一、技术路线
 
推荐平台:Illumina MiSeq、Illumina HiSeq 2000
 
 
二、信息分析
1.原始数据整理、过滤及质量评估
 
2.基因组序列拼装与分析:
 与参考基因组比对(共线性)
 基因组岛鉴定
 SNPs和InDel的检测及在基因组的分布
 CNV和SV的检测及在基因组的分布
 包含变异基因的COG和GO富集分析
 包含变异基因的代谢途径分析(KEGG pathway)
   
3.根据客户需求进行个性化分析
 
 
三、送样要求
1、 细菌:浓度≥200 ng/μl,总量≥50 μg ,OD260/280值介于1.8-2.0之间的细菌基因组DNA,并确保DNA无降解,无污染。
 
2、 真菌:样品浓度≥200 ng/μl,总量≥50 μg ,OD260/280值介于1.8-2.0之间的DNA,样品浓度越高越好。
 
3、 样品保存期间切忌反复冻融。
 
4、 送样管务必标清样品编号,管口使用Parafilm 膜密封。
 
5、 提供DNA电泳检测照片,用自封袋密封后随样品一起送样。
 


 
四、派森诺优势
HiSeq 2000测序通量可达600G,适合全基因组测序。80×以上的测序深度,可以保证数据的准确以及SNP的发现。MiSeq的速度更快,但相对来说成本会较高。
 
派森诺生物拥有多个高端测序平台,根据合作伙伴的实际需求,提供高性价比的微生物基因组重测序。
 
公司简介

        上海派森诺生物科技有限公司(以下简称派森诺生物)成立于20114月,公司总部位于上海市徐汇区,是在已有DNA一代测序合成平台基础上,以上海交通大学等海内外高等学校和科研院所的专家教授团队为技术依托,吸纳了多名基因组学和生物信息学高级专业技术人员加盟组成的高科技生物技术公司。

公司之所以取名派森诺生物(Personalbio)是这样考虑的:首先,人类基因组计划实施和完成,全面开启了生命科学新纪元,其正带动着生物科学研究和应用进入个性化时代;其次,测序技术的飞速发展,以测序中心独揽天下的局面也将被以实验室为单位个性化形式所打破和取代。另外,由于生物种类和客户需求目标的多样性,要求有针对性、个性化的专业服务。
派森诺生物紧紧跟踪全球测序技术发展步伐,2011年率先引进了亚太区第一台罗氏升级版测序平台(Roche 454 FLX+ system)和中国第一台Illumina新一代个人化测序平台(Illumina MiSeqTM),目前拥有Illumina HiSeqTM 2000、Illumina MiSeqTMRoche 454 FLX+三大高通量测序平台,确保了对不同类型、不同物种的测序需要。
派森诺生物拥有一支实力雄厚的序列测定和信息分析团队,在为合作伙伴提供标准化信息分析服务的基础上,将根据客户需要提供个性化的数据分析与培训。派森诺生物承诺,将为广大合作伙伴提供三大免费服务:免费设计科学合理的实验方案、免费提供常规生物信息分析和免费修改润色英文文稿。
派森诺生物始终以“解析序列,诠释生命”作为企业理念,秉承立足客户需要,满足个性需求的服务宗旨,专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、RNA测序、简化基因组及外显子捕获等技术服务。
目前公司合作伙伴遍布全国,包括中国科学院、中国农业科学院、上海交通大学、华东理工大学、内蒙古农业大学、南京大学、瑞金医院、新华医院、国家海洋局第一海洋研究所、华中农业大学、华南农业大学、温州医学院、上海海洋大学、山东农业大学、重庆市畜牧科学院、扬州大学等,已经完成和正在进行多项国家和省市重大或重点科研项目,受到合作伙伴的认同和好评。

售后服务
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