Small RNA测序
Small RNA测序
推荐平台:Illumina MiSeq
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.小RNA的注释:
小RNA定位到基因组
其它序列(tRNA、rRNA、intron、exon、snoRNA、snRNA)注释
microRNA注释
piRNA注释
microRNA的表达量分析
microRNA的表达量差异分析
microRNA表达模式聚类分析(热图)
microRNA保守性分析
靶基因预测
网络分析(靶基因互作网络)
新microRNA预测
4.根据客户需求进行个性化分析
1、 总RNA:浓度≥750 ng/μl,总量≥20 μg;OD 260/280介于1.8-2.2之间,OD 260/230值应≥2.0。电泳检测28S:18S至少大于1.5;RIN值≥8.0;并确保RNA无降解,无污染。或者提供浓度≥20 ng/μl,总量≥200 ng的 Small RNA样品。同时提供Small RNA样品QC数据,包括电泳图、分光光度或Nanodrop仪器检测数据。
2、 提取总RNA时,请避免使用过柱法和LiCl沉淀法,以避免Small RNA的丢失。
3、 样品保存期间切忌反复冻融。
派森诺生物利用Illumina MiSeq/HiSeq两大测序平台提供优质的Small RNA测序服务。其中IlluminaMiSeq平台具有测序周期短(1×35 bp模式的测序时间仅8小时)、分辨率高、精确度高、重复性好等优点。Illumina HiSeq平台具有费用低廉、通量高等优点,为Small RNA分子的发现和研究提供了极高的覆盖深度,能够检测丰度极低的稀有Small RNA。
派森诺生物将根据合作伙伴的实际需要,选择合适的测序平台为您提供个性化的高品质Small RNA测序服务。凭借经验丰富的测序团队、专业的信息分析人员和全面的技术支持,能在第一时间为您提供实验方案,解决实验问题,分析实验结果。
上海派森诺生物科技有限公司(以下简称“派森诺生物”)成立于2011年4月,公司总部位于上海市徐汇区,是在已有DNA一代测序合成平台基础上,以上海交通大学等海内外高等学校和科研院所的专家教授团队为技术依托,吸纳了多名基因组学和生物信息学高级专业技术人员加盟组成的高科技生物技术公司。
单位名称: |
详细地址:
上海徐汇区龙吴路777号7号楼3楼
|
qq:
1873818382
|
官网: |
联系电话: |
Email: |