宏基因组从头测序--性能参数，报价/价格，图片

基本信息

服务名称：

宏基因组从头测序

英文名称：

参考报价：

服务商：

上海派森诺生物科技有限公司

总点击数：

1431

更新日期：

2013-09-03

服务类别：

测序/合成

服务详情

宏基因组从头测序

简介：宏基因组学（Metagenomics）也称为元基因组学，是以样品中的微生物群落作为整体进行研究的学科。宏基因组de novo测序是指对环境样品中所有微生物基因组DNA片段化后进行高通量测序，进行序列组装和基因注释，获得部分不可纯培养微生物的基因组序列，分析该环境下所有微生物基因集信息。

一、技术路线

推荐平台：Roche 454 FLX+、Illumina HiSeq 2000

二、信息分析

1.原始数据整理、过滤及质量评估

2.基因集分析：

基因功能注释

基因功能丰度差异分析

丰度差异的基因 GO 富集分析

丰度差异的基因 KEGG 富集分析

聚类分析（热图）

多元统计分析（根据实验设计）

3.基于物种丰度分析：

稀释曲线

Alpha多样性分析

物种丰度差异分析

聚类分析（热图）

多元统计分析（根据实验设计）

4.基于群落结构分析：

单样品物种分布

多样品物种分布

5.微生物基因组序列组装和拼接

6.根据客户需求进行个性化分析

三、送样要求

1、样品采集：采集条件的一致是最为重要的环节，需严格按照标准采样，采样后立即冷冻保存。

2、样品DNA：环境因素异常复杂，许多物质或抑制因子会影响后续PCR、测序文库构建和序列测定，常规提取方法不一定适合，建议按公司要求采用专用试剂盒提取。基因组DNA浓度＞100 ng/μl，总量＞20 μg，OD 260/280在1.8-2.0之间，并确保电泳检测无明显RNA条带，基因组条带清晰、完整；基因组DNA完全无降解；提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。

3、送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm膜密封。

四、派森诺优势

1. 先进的平台优势：Roche 454 FLX+超长读长保证了三个V区的完整测序，大大提高了环境微生物检测灵敏度。Illumina 测序平台的高通量确保了检测的准确度并大大降低了测序费用。

2. 开发了一套成熟的平行测序方案，可支持超过200个样本的平行测序。

3. 完备的样品检测和预实验体系，为后续测序顺利开展奠定了基础。

4. 丰富的经验，成熟的数据处理和分析系统。

公司简介

上海派森诺生物科技有限公司（以下简称“派森诺生物”）成立于2011年4月，公司总部位于上海市徐汇区，是在已有DNA一代测序合成平台基础上，以上海交通大学等海内外高等学校和科研院所的专家教授团队为技术依托，吸纳了多名基因组学和生物信息学高级专业技术人员加盟组成的高科技生物技术公司。

公司之所以取名派森诺生物（Personalbio）是这样考虑的：首先，人类基因组计划实施和完成，全面开启了生命科学新纪元，其正带动着生物科学研究和应用进入个性化时代；其次，测序技术的飞速发展，以测序中心独揽天下的局面也将被以实验室为单位个性化形式所打破和取代。另外，由于生物种类和客户需求目标的多样性，要求有针对性、个性化的专业服务。

派森诺生物紧紧跟踪全球测序技术发展步伐，2011年率先引进了亚太区第一台罗氏升级版测序平台（Roche 454 FLX+ system）和中国第一台Illumina新一代个人化测序平台（Illumina MiSeq^TM），目前拥有Illumina HiSeq^TM2000、Illumina MiSeq^TM和Roche 454 FLX+三大高通量测序平台，确保了对不同类型、不同物种的测序需要。

派森诺生物拥有一支实力雄厚的序列测定和信息分析团队，在为合作伙伴提供标准化信息分析服务的基础上，将根据客户需要提供个性化的数据分析与培训。派森诺生物承诺，将为广大合作伙伴提供三大免费服务：免费设计科学合理的实验方案、免费提供常规生物信息分析和免费修改润色英文文稿。

派森诺生物始终以“解析序列，诠释生命”作为企业理念，秉承“立足客户需要，满足个性需求”的服务宗旨，专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、RNA测序、简化基因组及外显子捕获等技术服务。

目前公司合作伙伴遍布全国，包括中国科学院、中国农业科学院、上海交通大学、华东理工大学、内蒙古农业大学、南京大学、瑞金医院、新华医院、国家海洋局第一海洋研究所、华中农业大学、华南农业大学、温州医学院、上海海洋大学、山东农业大学、重庆市畜牧科学院、扬州大学等，已经完成和正在进行多项国家和省市重大或重点科研项目，受到合作伙伴的认同和好评。

售后服务

联系方式

单位名称：

上海派森诺生物科技有限公司

详细地址：

上海徐汇区龙吴路777号7号楼3楼

qq：

1873818382

官网：

http://www.personalbio.cn

联系电话：

021-61919859

61919860

Email：

market@personalbio.cn

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