CHIP-seq技术
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简介：染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP 与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq 技术，能够高效地检测全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。 ChIP-Seq 的原理是：首先通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段，并对其进行纯化与文库构建；然后对富集得到的DNA 片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。
二、信息分析
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.ChIP-Seq序列与参考基因组序列的比对
3.Peak Calling（统计每个样品的Peak片段信息）
4.Peak Annotation（根据已有的基因组数据库注释信息获得所有Peak位点信息）
5.Motif预测、基因集分析。
6.全基因组范围的峰值分布
7.基因组水平和感兴趣区域的数据可视化。
三、送样要求
1.样品质量要求：ChIP DNA OD260/280应在1.8至2.0之间。DNA片段大小在100~500bp范围内，主带明显，建议在250bp左右，同时请提供DNA打断时的检测胶图。样品最好经过ChIP-PCR验证。
2.样品浓度要求：样品量≥60ng（3次），浓度≥200pg/ ul。若单次ChIP后DNA量不够，建议将2~3次ChIP的DNA合并在一起。
3.样品包装：样品溶于超纯水中，放于DNase-free的1.5ml离心管中，管口用封口膜封号。请在样品管上做好清楚的标识，最好写在标签纸上，贴在管壁。
4.请仔细填写样品信息表，并且请同时提供质量检测相关数据和图片，包括分光光度、电泳胶图或Nanodrop仪器检测数据等。同样品一起送样。
5.样品运输：DNA样品请用干冰或者冰袋运输。干冰运输时间不要超过72小时；冰 袋运输，时间最好不要超过24小时。
四、应用领域
由于ChIP-Seq 的数据是DNA 测序的结果，为研究者提供了进一步深度挖掘生物信息的资源，研究者可以在以下几方面展开研究：
1.判断 DNA 链的某一特定位置会出现何种组蛋白修饰；
2.检测 RNA polymerase II 及其它反式因子在基因组上结合位点的精确定位；
3.研究组蛋白共价修饰与基因表达的关系；
4.CTCF 转录因子研究。
公司简介
上海派森诺生物科技有限公司（以下简称“派森诺生物”）成立于2011年4月，公司总部位于上海市徐汇区，是在已有DNA一代测序合成平台基础上，以上海交通大学等海内外高等学校和科研院所的专家教授团队为技术依托，吸纳了多名基因组学和生物信息学高级专业技术人员加盟组成的高科技生物技术公司。
公司之所以取名派森诺生物（Personalbio）是这样考虑的：首先，人类基因组计划实施和完成，全面开启了生命科学新纪元，其正带动着生物科学研究和应用进入个性化时代；其次，测序技术的飞速发展，以测序中心独揽天下的局面也将被以实验室为单位个性化形式所打破和取代。另外，由于生物种类和客户需求目标的多样性，要求有针对性、个性化的专业服务。
派森诺生物紧紧跟踪全球测序技术发展步伐，2011年率先引进了亚太区第一台罗氏升级版测序平台（Roche 454 FLX+ system）和中国第一台Illumina新一代个人化测序平台（Illumina MiSeqTM），目前拥有Illumina HiSeqTM 2000、Illumina MiSeqTM和Roche 454 FLX+三大高通量测序平台，确保了对不同类型、不同物种的测序需要。
派森诺生物拥有一支实力雄厚的序列测定和信息分析团队，在为合作伙伴提供标准化信息分析服务的基础上，将根据客户需要提供个性化的数据分析与培训。派森诺生物承诺，将为广大合作伙伴提供三大免费服务：免费设计科学合理的实验方案、免费提供常规生物信息分析和免费修改润色英文文稿。
派森诺生物始终以“解析序列，诠释生命”作为企业理念，秉承“立足客户需要，满足个性需求”的服务宗旨，专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、RNA测序、简化基因组及外显子捕获等技术服务。
目前公司合作伙伴遍布全国，包括中国科学院、中国农业科学院、上海交通大学、华东理工大学、内蒙古农业大学、南京大学、瑞金医院、新华医院、国家海洋局第一海洋研究所、华中农业大学、华南农业大学、温州医学院、上海海洋大学、山东农业大学、重庆市畜牧科学院、扬州大学等，已经完成和正在进行多项国家和省市重大或重点科研项目，受到合作伙伴的认同和好评。
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