芯片与生物信息学

Small RNA(Micro RNA)研究

基本信息
服务名称:
Small RNA(Micro RNA)研究
英文名称:
Small RNA(Micro RNA) analysis
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1179
更新日期:
2014-05-12
服务类别:

服务详情

      Small RNA是一类高度保守的长度在18-30 nt的具有调节功能的内源性非蛋白质编码RNA分子,主要包括:miRNAncRNAsiRNAsnoRNApiRNArasiRNA等等,主要位于基因间和内含子区域。Small RNA几乎存在于所有的生物体内,通过与靶mRNA的特异结合导致mRNA降解或者翻译受抑制,最终调控基因的表达,对生物个体发育、代谢及疾病的发生等起着重要的影响。

     

瑞科基因服务内容:生物信息分析。

   主要包括:

1、 小RNA长度分布;

2、 Small RNA的分类注释;

3、 鉴定已知的miRNA预测新的miRNA和miRNA前体;

4、 miRNA表达量分析与表达差异分析(表达差异需2个以上样品)

5、 miRNA的靶基因预测,预测miRNA在生长发育过程中的作用;

6、 miRNA的靶基因GO,KEGG分析;

7、 miRNA与物种转录组数据联合分析(定制化);

8、 miRNA靶基因与降解组联合研究(定制化)。

 

 

Small RNA的主要研究手段

    对small RNA的检测主要是通过生物芯片技术,但这些技术只能局限于研究那些序列已知的small RNA,无法发现和研究未知的small RNA分子。基于新一代高通量测序平台Illumina系统,一次可获得数百万条Small RNA序列,可以鉴定并定量出任何物种不同组织、不同发育阶段、不同疾病状态下全基因组水平的Small RNA。

  Illumina系统平台的Small RNA研究常用测序策略:Hiseq 2000,1×36 bp或1×50 bp,文库构建试剂盒:Illumina TruSeq Small RNA Pre Kit。该试剂盒既可使用total RNA,也可使用纯化好的small RNA为起始样品。

公司简介

广州瑞科基因科技有限公司(Science Corporation of Gene),以生物信息技术为基础,注重生物信息的深层次挖掘与应用。在科学研究领域,瑞科致力于提供更为完善,面向对象的生物信息分析方案,使生物信息技术更有效地服务于科学研究,发挥信息技术的更大价值。 科学为本,技术创新,瑞科基因致力于用数字化信息技术推动生物技术的发展应用。
    公司主要服务内容:DNA变异检测分析,基因组组装,转录组生物信息分析,新表达谱,DNA甲基化研究,常规测序分析,其他。


    
 


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