测序/合成

全基因组关联分析

基本信息
服务名称:
全基因组关联分析
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1222
更新日期:
2013-08-26
服务类别:

服务详情

应用目标:选取该物种1000个以上重要种质资源进行全基因组分子标记开发,筛选与重要农艺性状紧密关联的候选区域,同时可以进行该物种遗传结构分析。

已有或即将有全基因组参考序列的物种。如玉米、大豆、水稻、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、番茄、拟南芥、猪、牛、鸡、兔子等物种。
从目标物种自然变异群体中选取核心种质,原则为:覆盖尽可能广的地域(不同环境及生长条件),尽可能多的农艺性状,尽可能全的品系(野生种、半野生种、栽培种等)。
利用单元型区域进行种质资源挖掘的研究思路
构建目标物种系统发育树

基于多态性分子标记定义目标物种不同品种间的亲缘关系,绘制物种系统发育树来研究其演化过程。

群体进化树:每个节点代表一个或几个个体,枝长代表进化距离。
单体型预测

根据连锁不平衡理论,对所有品种中共同遗传而很少重组的区域进行预测,通过LD分析,定义单体型。

LD图谱:横向为各个多态性位点在基因组上对应的位置,通过计算两两间的连锁不平衡率,定义单体型。
公司简介
百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月,是一家高新技术企业,公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术,拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块;拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队;公司自成立以来,注重创新发展,科研成果成果层出不穷,先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇,累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项,软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台,满足科研工作者多种科研需求,努力打造基因产业国际一流企业,“为世界创造新的可能!”

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