基于SLAF-seq技术的super BSA
应用目标:针对较大分离群体能更精细的将筛选到的关联紧密的候选区域在基因组上定位,直接对该区域进行功能基因的精细注释,获得性状相关候选基因。
应用目标:针对较大分离群体进行目标性状分子标记开发,更准确的对分子标记与性状的关联性强弱进行排序分析,由此获得的强关联性分子标记为下游的基因精细定位工作打下坚实基础。
研究对象
根据标记密度和标记测序深度等开发需求的不同,设计了3种方案,详细内容如下表所示。根据不同的研发需求可以定制个性化方案。
项目资源要求 |
标准解决方案 |
推荐解决方案 |
深入解决方案 | |
群 体 需 求 |
亲本 |
2 |
2 |
2 |
亲本多态性 |
>10% |
>10% |
>10% | |
群体大小 |
50+50 |
100+100 |
200+200 | |
适用群体类型 |
临时群体、永久群体和自然群体 | |||
性状分离 |
需要 |
需要 |
需要 | |
区分个体 |
否 |
否 |
否 | |
测 序 标 准 |
亲本标签测序深度 |
10x |
20x |
20x |
个体标签平均测序深度 |
1x |
1x |
1x | |
总体标签测序深度 |
120x |
240x |
440x | |
标签个数 |
20,000 |
50,000 |
70,000 |
整体计划3个月完成多态性标记开发及其与目标性状的关联分析,具体时间规划如下表所示。根据物种的不同开发时间会稍有不同。
技术路线
![]() A: 亲本SNP和inDel标记开发 B:super BSA快速定位流程 |
单位名称: |
详细地址:
北京市顺义区南法信府前街12号顺捷大厦A座6层
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qq:
270247138
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官网: |
联系电话: |
Email: |