基于SLAF-seq技术的多态性图谱
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技术应用范围
应用目标：获得大量有序列的分子标记，直接构建物种的分子标记指纹数据库，建立物种分子鉴定平台。为后续研究打下基础。
目前没有基因组参考序列，无法通过重测序等手段高效定义多态性的物种。如小麦、棉花、油菜、辣椒、鱼类、对虾、花卉、林木、大麦、药用植物等。
已有或即将有全基因组参考序列，利用重测序寻找多态性对成本要求过高的物种。如玉米、大豆、水稻、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、烟草、番茄、拟南芥等物种。
研究对象及条件
拥有2个以上具有表型差异的个体材料，个体间差异越大越有利于找出更多的多态性分子标记。该技术尤其适用于骨干亲本的遗传差异鉴定。
针对构建临时（如F2分离群体）或永久群体（如重组自交系、近等基因系、双单倍体系、回交近交系等）的父、母本材料进行多态性分析，可以利用找出的多态性标记到群体里进行与目标性状的关联性分析。
项目开发方案
根据标记密度和标记测序深度等开发需求的不同，设计了3种方案，详细内容如下表所示。根据不同的研发需求可以制定个性化方案。
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项目资源要求 |
标准解决方案 |
推荐解决方案 |
深入解决方案 | |
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群 体 需 求 |
个体 |
≥2 |
≥2 |
≥2 |
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亲本多态性 |
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群体大小 |
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适用群体类型 |
遗传群体和自然群体 | |||
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性状分离 |
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区分个体 |
是 |
是 |
是 | |
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测 序 标 准 |
亲本标签测序深度 |
/ |
/ |
/ |
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个体标签平均测序深度 |
5x |
5x |
5x | |
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总体标签测序深度 |
5x |
5x |
5x | |
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标签个数 |
50,000 |
100,000 |
200,000 | |
基于SLAF-seq技术的多态性图谱绘制方案
项目开发时间
整体计划3个月完成分子标记开发及多态性图谱绘制，具体时间规划如下表所示。根据物种的不同开发时间会稍有不同。
基于SLAF-seq技术的多态性图谱绘制开发时间
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技术路线
  基于SLAF-seq技术的多态性图谱绘制技术路线示意图 |
公司简介
百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技术企业，公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术，拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块；拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队；公司自成立以来，注重创新发展，科研成果成果层出不穷，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇，累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项，软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台，满足科研工作者多种科研需求，努力打造基因产业国际一流企业，“为世界创造新的可能！”
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