外显子组及目标区域深度测序
外显子组:是指全部外显子区域的集合,该区域包含合成蛋白质所需要的重要信息,涵盖了与个体表型相关的大部分功能性变异。外显子组测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。
主要优势在于可针对特定区域进行测序,有效的降低了测序成本,提高了测序深度,能够更为经济有效精确地发现特定区域遗传变异的信息。
1.目标物种DNA提取,检测合格;
2.对基因组DNA进行片段化处理后进行末端修复;3’末端加“A”,扩增并纯化扩增产物;
3.将检测合格的产物与探针结合,实现目标区域的富集;
4.富集片段两端加上测序接头,实现扩增;
5.在经qPCR质量检测合格后进行Solexa高通量测序。
基本分析
- 数据产出的统计,InsertSize长度检验
- 外显子区域测序深度统计
- 外显子捕获的均一性分析
- SNP及Indels的检测
- SNP及Indels的注释
高级分析
- 氨基酸替代的预测分析
- 群体SNP的获取和等位基因频率评估
- 孟德尔遗传疾病分析
- 全基因组关联(GWAS)分析
- 阳性信号的检测
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