ChIP-Seq测序
真核生物的基因组以染色质的形式存在,染色质是由DNA和蛋白质组成的复合物,研究DNA和蛋白质在染色质形式下的相互作用对于阐明真核生物的基因表达机制具有重要意义。
染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation, ChIP)是研究蛋白质与DNA相互作用的经典实验方法,广泛的应用于组蛋白特异性修饰位点、转录因子结合位点等的研究。
随着新一代测序技术的成熟与发展,整合了染色质免疫共沉淀与高通量测序技术的ChIP-Seq,是继ChIP-Chip之后,蛋白质与DNA相互作用研究的又一技术突破。
ChIP-Seq采用特异抗体对目的蛋白进行免疫沉淀,分离与目的蛋白结合的基因组DNA片段,对其进行纯化和文库构建,再通过高通量测序的方法,在全基因组范围内寻找目的蛋白的DNA结合位点,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA片段信息。
全基因组覆盖:与ChIP-chip相比,ChIP-Seq可在全基因组范围对蛋白结合位点进行筛选与鉴定。 ●高灵敏度:每个样本可获得数百万条的序列标签,可发现研究基因组上稀有的蛋白结合位点。 ●高精确率:可获得高水平的信噪比数据,准确区分真实事件与噪音,精确定位蛋白结合位点。 ●高性价比:仅需较少的数据量即可鉴定全基因组范围内的结合位点,且花费仅为全基因组ChIP-chip的1/30~1/10
信息分析流程:
产前筛查、产前诊断的专业公司
北京贝瑞和康生物技术有限公司(以下简称贝瑞和康)成立于2010年5月,专注于将新一代DNA测序技术应用于临床基因检测领域以及为生命科学、临床疾病研究以及其他生物、医学领域的广大科研工作者提供新一代测序技术服务。总部设在北京,现已在国内20多个省市自治区与超过300家医院建立合作关系。拥有高标准的研发、市场、销售、客户服务等体系,共有400多名员工,并建立以北京为中心,青岛、上海三地的临床检测中心格局。
我们研发的贝比安TM无创DNA产前检测(简称贝比安TM)可针对唐氏综合征(T21)、爱德华氏综合征(T18)、帕陶氏综合征(T13)这三种也是目前最常见的三大染色体疾病进行高精度的检测。并针对该技术率先与中南大学湘雅医院产前诊断中心、北京协和医院完成两期大规模的临床试验,检测结果均显示该技术对三大染色体疾病的检测准确率高达99%以上,这是20多年来基因组学首个真正意义上能够进入临床应用领域的创新性突破,也是人类基因组工程在实践应用上的第一个范例。
另外,我们于2013年1月与医学检测领域享誉国际的美国贝勒医学院正式签署了一份ArrayCGH合作协议,将正式开展ArrayCGH产前诊断服务。我们不仅可以使用贝勒医学院自主设计的最全面的比较基因组芯片,而且还授权使用全球最大最全面的包含50000份样本的人类染色体疾病数据库,为产前诊断的遗传咨询提供有效助力。我们希望能够为临床的妇幼保健工作者提供基于基因组学的产前筛查和产前诊断的整体解决方案。
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