lncRNA 筛选——高通量测序服务
1. 简介
长链非编码RNA（Long noncoding RNA，lncRNA）是一类转录长度大于200nt的RNA分子，属于ncRNA（noncoding RNA，ncRNA）中片段较大的一些基因，它们本身缺乏明显的开放阅读框，不编码蛋白，而是以RNA的形式在多种层面上调控基因的表达。近几年来，ncRNA的研究越来越多，随着一些ncRNA基因的克隆以及计算机生物信息学预测方法的发展，人们逐渐认识到ncRNA和蛋白质分子一样参与了整个的生命活动。研究发现，已鉴定的ncRNA几乎参与了生命活动的每个环节，包括基因转录调控、基因印迹与沉默、mRNA的稳定和翻译、蛋白质的转运和定位等。
目前预测的lncRNA多达数千个，但是科学家预计，哺乳动物基因组序列中大约4%~9%的序列产生的转录本是lncRNA，而只有1%的编码蛋白序列。RNA高通量测序一次性产生上百万RNA序列，能够快速鉴定特定条件下表达的lncRNA。通过lncRNA高通量测序，能够发现新的lncRNA。
为了深入研究lncRNA功能，赛哲生物推出基于Ion torrent高通量测序平台的lncRNA-Seq服务，通过基于去除核糖体RNA的建库方法以及高通量测序技术，可以得到细胞内所有RNA转录产物的序列，并通过后期的生物信息学分析，可对lncRNA进行深入的研究。
2. 技术特点
- 任意物种的检测：无需了解物种的基因或基因组信息，便可直接对任意物种进行最全面的转录组分析。可检测未知基因，发现新的转录本；
- 高精确度：数字化信号，可精确检测到基因家族中相似基因以及可变剪切造成的不同转录本的单碱基差异；
- 高覆盖度：新一代高通量测序技术的高深度覆盖，可以检测到低丰度的稀有转录本。
3. 价格及实验周期
| 项目名称 | 项目明细 | 周期（工作日） | 单位（元） |
|---|---|---|---|
| lncRNA测序 | lncRNA分离纯化 | 20 | 25,000 |
| 文库制备 | |||
| 模板制备 | |||
| 高通量测序 | |||
| 数据分析 |
4. 服务流程
方案制定
根据样品信息和客户要求，制定测序方案
样本检测
Agilent 2200
Nanodrop 2000
文库制备
从总RNA中分离出mRNA，反转成cDNA，构建文库
或从总RNA中去除rRNA，反转成cDNA，构建文库
上机测序
Ion torrent上机测序
数据分析
基本数据分析
高级数据分析
作为首家签约进驻广州国际生物岛研发区的公司，公司已拥有占地面积600多平米的的实验室，其中包括分子生物学实验室、细胞生物学实验室、病毒研究实验室和药物或功能小分子标准化实验室，相应配置了一些高档的实验仪器如实时定量PCR、倒置显微镜、逆流色谱等。
公司建立一年多来，已经成为国内“3D细胞培养”的首屈一指的机构，这项技术的建立和完备将在生物化学领域和药理学研究领域产生产生革命性突破，将给科学家提供能接近活体实验的可靠数据和药筛模型。在蛋白泛素化的研究，技术体系已完善，泛素相关蛋白已逐步成为肿瘤治疗的药靶。在天然产物的分离提纯方面，在引入先进仪器逆流色谱的同时，公司已掌握分离纯化天然药物的单提小分子技术，已搭建起药理学研究的平台，加之“3D细胞培养”技术的引入及完善，为药理学的研究平台提供更加可靠的数据，新药的药理分析及试验提供更好的依据。其中新兴的部门生物美学部也将药物的药理可视化，通过绘制插图和动画制作，将更好的呈现药物的机理。
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详细地址：
广州市国际生物岛螺旋四路一号研发A区第三层304、305单元；研发B区第三层303、304、305、307单元；上海市徐汇区肇嘉浜路201号生资大厦327室。
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