【技术原理】
MassARRAY时间飞行质谱生物芯片系统由专业生产生物芯片系统用于遗传突变及SNP领域研究的美国Sequenom公司开发，是目前唯一采用质谱法直接检测SNP的设备。MassARRAY系统已用作在不同人种中寻找的异性的SNP，称之为Hapmap计划。该系统的突出特点是能以极高的精确度快速进行基因型识别，直接测出带有SNP或其他突变的目标DNA。MassARRAY系统反应体系为非杂交依赖性，不存在潜在的杂交错配干扰，不需要各种标记物，其采用的高密度SpectroCHIP点阵芯片分析系统能在4小时之内完成多达3840个多重性鉴定，每个检测点只需3-5秒，全自动分析。这套系统及时提供了大规模、高能量检测SNP的技术平台，顺应了当前医学疾病基因组疾病机制研究迅猛发展的趋势。
Sequenom SNP检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)技术。主要特点是，PCR扩增后的产物，加入SNP序列特异延伸引物，在SNP位点上，延伸1个碱基。然后将制备的样品分析物与芯片基质共结晶，将该晶体放入质谱仪的真空管，而后用瞬时纳秒(10-9s)强激光激发，由于基质分子经辐射所吸收的能量，导致能量蓄积并迅速产热，从而使基质晶体升华，核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子，产生的离子多为单电荷离子，这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能，进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离，在真空小管中飞行到达检测器。MALDI产生的离子常用飞行时间(Time-of-Flight, TOF)检测器来检测，离子质量越小，就越快到达。理论上讲，只要飞行管的长度足够，TOF检测器可检测分子的质量数是没有上限的。MASSARRAY SNP检测的质谱范围为5000到8500 Dalton。

【技术特点】
灵活：
• 可以自由选择感兴趣的SNP位点
• 一张芯片上，样本的数量和位置可以自由选择
• 一张芯片上，样本和SNP位点的配对可以自由选择
准确：
• 直接检测待测物分子量，准确度超过99.7%
• 质谱技术灵活检测PCR实验失败或三等位基因的存在
高通量：
• 一张芯片上可完成384个样品的多重iPLEX GOLD实验
• 每个反应孔可实现多达40重反应
• 每天最多能进行十万个基因型分析
性价比高：
• 无需荧光标记，成本大大降低
• 即便在低通量的情况下每个基因型分析的成本仍然很低

【服务内容】
(1) 客户提供基因组DNA或者或者生物样本，并指定需要检测SNP位点
(2) 设计引物(包括PCR扩增引物和单碱基延伸引物)
(3) 多重反应的设计
(4) PCR扩增、SAP处理、单碱基延伸
(5) 点样制备检测用芯片阵列
(6) MALDI-TOF质谱检测
(7) 数据分析、给出分型报告

上海生物样本库工程研究中心以解决我国生物样本搜集利用中存在的信息共享、伦理法律、人员培训、质控、技术服务和市场化服务等问题，以协调各方利益，降低重复建设投入，促进科研合作，提高效率，真正实现广泛参与，科学高效的临床样本搜集格局，促进我国样本搜集利用水平的整体提高和转化医学的快速发展，服务于国家创新战略，提高我国生物及生物医药产业的国际竞争力。

由于生物样本库的建设需要医院、科研院所、大学、社区卫生中心、电信运营部门等多部门跨学科，跨行业，跨传统行政管理体系的合作。因此，必须建立一个强有力的各部门行政领导联席的协调机构，以保证政策的统一和项目的顺利发展。基于“政府引导，社会参与、市场化发展的原则”，我们建议由政府(科技，卫生部门)主管部门领导或其推荐的生物医学和临床医学领域的权威专家共同组成理事会，负责跨部门，跨系统之间就样本库建设项目的沟通、协作与联合，从而保证样本库建设的多方力量协调。在其领导和监督下，建立以科学委员会和伦理和法律委员会为辅助的，由专门的机构(执行委员会)负责实施的组织架构。