mRNA有参考基因组解决方案
服务详情
目前常见模式生物的基因组序列大都被测序出来，针对这些物种的转录组分析设计的方案称之为有参考基因组解决方案。
硬件需求
有参考基因组转录组分析对硬件的需求主要在比对这一环节。内存的容量是比对速度的关键因素。
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解决方案概要
测序数据质量控制
与参考序列比对
比对数据质量控制
可变剪接分析以及新转录本预测
差异表达分析
解决方案模块选择
与参考序列比对
比对数据质量控制
可变剪接分析以及新转录本预测
差异表达分析
解决方案模块选择
| 测序数据质量控制 | FastQC 、PringSeq |
| 测序数据预处理 | FASTX-Toolkit 、Cutadapt |
| 与参考序列比对 | BWA、Bowtie Tophat |
| 比对数据质量控制 | RSeQC、Qualimap、RNA-SeQC |
| 可变剪接分析以及新转录本预测 | Cufflinks、Scripture |
| 差异表达分析 | Cuffdiff、DESeq、DEXseq、DEGseq、EdgeR |
| SNP calling | Samtools、SOAPsnp |
| 差异基因GO 富集和Pathway 富集分析 | GOSeq、DAVID、KEGG |
| 差异基因互做网络 | Cytoscape |
公司简介
北京华弈生物科技有限责任公司成立于2013年7月，专注于将全球领先的信息化技术应用于生命科学、健康等相关产业。华弈始终秉承科学、严谨的工作作风，为用户的科研工作提供高价值的个性化服务，为市场提供高效可靠的生物信息技术与产品。与此同时，我们严格围绕用户核心需求，开展个性化培训，为我国生物信息行业培养了大批专业人才。今后，我们将以执着的精神和务实的态度不懈追求，致力于推动我国新兴产业的自主创新发展，服务于中华民族自主创新发展战略！
华弈期待您的加入，让我们共同用创新成就梦想！
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