测序/合成

全长鸟枪法测序

基本信息
服务名称:
全长鸟枪法测序
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总点击数:
1729
更新日期:
2014-12-18
服务类别:

服务详情

 司拥有ABI3730xl测序平台和齐全的配套设施,其全基因组鸟枪法测序(Whole Genome Shotgun Sequencing),无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱,采用最经济有效的实验设计方案,直接将整个基因组打成不同大小的DNA片段构建Shotgun文库,对文库进行随机测序,最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。公司测序平台目前已经完成十余例50kb到500kb大小基因组 测序服务项目,积累了丰富的经验。

 

全基因组鸟枪法测序的主要步骤是:第一,建立高度随机、插入片段大小为1.6kb到4kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量,即经过两端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组大小的6到10倍。第二,高效、大规模的克隆双向测序。第三,序列拼装。借助Phred, Phrap, Consed 软件进行序列组装,产生一定数量的contig。第四,填补缺口。有两种待填补的缺口,一是没有相应模板DNA的物理缺口,我们通过PCR的方法进行填补;二是有模板DNA但未测到的序列缺口。我们直接在模板DNA上设计引物测序。

 

项目适用范围

BAC、Fosmid、cosmid、线粒体、叶绿体等

服务内容

基本服务内容:shotgun文库构建,大规模测序,序列组装。

高级服务内容:信息处理和分析,包括比较基因组、基因功能注释和分类。

样品要求

动物、植物、微生物组织请提供足量的新鲜样品(4℃保存,不超过一天)或将新鲜样品立即存于液氮或-80℃,一周内寄样。

已纯化 DNA要求浓度>10ng/ul ,最小量>20ug,OD 260 /OD 280值:1.80~2.00

公司简介

我公司专业提供定量pcr、wb免疫组化、免疫荧光、elisa细胞培养文库构建等技术服务。
并且提供自产抗体3000多种(可以免费申请试用装)即用型水试剂。常用生化试剂!
 


售后服务
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