菲沙一体化生物信息分析服务
随着测序技术的发展，能够更加容易的获取基因组数据和转录组数据。然而，在海量数据中，您将需要的不仅仅是一面放大镜去寻找研究问题的答案，更重要的是需要有一个实力生物信息学团队帮您排忧解难。菲沙基因实力科研团队可以帮助您挖掘数据中的丰富潜能。
成功案例
- 甜橙基因组序列分析分析其物种起源 (图1, Nature Genetics1).
- 疟疾寄生虫的基因组对比发现关键酶可能与人类疾病有关 (图2, PLoS Computational Biology2).
- 100个肝癌组织的突变分析发现了独特的突变特征 (Nature Genetics, under review).
- 利用全基因组测序挖掘出模式生物表型差异的遗传基础 (Genetics3; BMC Genomics, in press).
- 松材线虫肠道微生物的宏基因组分析揭示了松木树脂降解过程中的关键共生关系 (Scientific Reports4).
菲沙优势
1. 际领先视野和影响力专家阮一骏，陈楠生，和Jeffrey Chu博士组成的顶尖的科学技术团队
2. 与专家面对面会谈并协助项目方案设计
3. 算法、流程开发与个性化信息分析能力强
4. 快速解决问题和成果产出能力强
我们的服务
疾病研究 农作物和模式生物
癌症驱动基因分析 基因组重测序和新基因组组装
遗传病、罕见疾病致病基因以及机理检测 全基因组和转录组研究
基因组SNV, CNV, 基因融合, 和复杂突变检测 表型和基因型的相关性分析
疾病独特基因谱检测 基因表达分析
… 物种进化过程分析
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病原体 宏基因组学
潜在的致病因素检测 环境和组织微生物种类和丰度分析
基因家族变化分析 重要代谢通路构建
病原体宿主相互作用 微生物meta特殊功能相关基因及机理分析
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参考文献
1. Xu, Q. et al. The draft genome of sweet orange (Citrus sinensis). Nature Genetics 45, 59-66 (2013).
2. Frech, C. & Chen, N. Genome comparison of human and non-human malaria parasites reveals species subset-specific genes potentially linked to human disease. PLoS Computational Biology 7, e1002320 (2011).
3. Chu, J.S. et al. Allelic ratios and the mutational landscape reveal biologically significant heterozygous SNVs. Genetics 190, 1225-33 (2012).
4. Cheng, X.Y. et al. Metagenomic analysis of the pinewood nematode microbiome reveals a symbiotic relationship critical for xenobiotics degradation. Scientific Reports 3, 1869 (2013).
个性化生物信息分析
生命世界充满各种耐人寻味的奥秘，大量生物科学家着迷与此，致力于剖析生命现象的本质，而高通量测序技术成为了生物研究领域的新星。相比后续生物信息分析而言，测序数据的产出变得越来越容易。鉴于研究目的和研究对象的不同，单一套路式的信息分析流程已经无法满足科研人员的需求。
菲沙基因拥有多名海内外知名的生物信息专家，以及大量经验丰富的生物信息分析工程师，可以从合作伙伴的研究热点、材料特殊性、关注的生物学核心问题出发，为您提供定制化的生物信息分析服务。
软件和算法开发
菲沙基因拥有一批高水平的生物信息研发团队，团队核心成员均拥有生物学和计算机科学双学位，具有极强的专业素养和软件开发能力，具有生物软件自主开发的能力。目前公司已经开发了如下生物信息软件：
基因建模软件genBlast系列，包括genBlastA和genBlastG
用于寻找并分析基因组共线性的生物信息学软件OrthoCluster以及OrthoClusterDB
用于比对基因和蛋白质结构的生物信息学软件FeatureStack
分析遗传多样性对基因突变作用的生物信息学软件CooVar
第三代DNA测序方法的生物信息学软件VariationBlast
菲沙基因提供专业的生物信息软件的开发和使用服务，并可以帮助客户开发指定功能的生物信息学软件。
生物数据库的开发和维护
菲沙基因核心技术团队人员参与构建了大型生物信息学平台 WormBase，拥有大型生物数据库开发的经验，可以帮助科研人员构建特定物种的生物数据库。
高质量论文修改
三代测序数据信息分析
生物信息培训
依托国际先进的第二代和第三代高通量测序平台，以及20万亿次的高性能计算平台，菲沙基因可以针对人类健康、疾病防治、环境保护、动植物研究、微生物应用等不同领域的基因组学问题展开研究，能够为不同需求的合作伙伴提供包括实验设计、样品选取、测序策略，以及后续定制化信息分析在内的一站式、个性化整体解决方案。
随着科学技术的发展，即将到来的基因组学第三次浪潮——三维基因组研究，已经成为全球生物学界的科研焦点。菲沙基因在提供3C、4C、5C、Hi-C等三维基因组构象技术服务的基础上，在国内率先引进最新的染色质远程交互测序技术（ChIA-PET），为进一步研究基因组三维空间结构与功能提供了完整解决方案，能够协助合作伙伴在下一轮基因组研究浪潮中抢占学科发展的有利先机。
凭借全球领先的生物信息分析能力，菲沙基因已经以多种形式先后与国内外著名高校和科研机构展开了深度合作，合作伙伴包括杰克森实验室、西蒙菲沙大学、中国科学院、中国农科院、清华大学、上海交通大学、复旦大学、华中农业大学、第二军医大学、同济医院、上海东方肝胆外科医院等。
“以生物信息学助推生命科学的研究，以基因组医学促进人类健康的发展”是菲沙基因的使命；“成为生物信息学领域的引领者”是菲沙基因的愿景。我们期望与各领域的专家合作，制定最优的解决方案，提供快速、准确、专业的服务，共同迎接生命科学研究中的挑战。
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