测序/合成

翻译组测序服务

基本信息
服务名称:
翻译组测序服务
英文名称:
TRAPSeq (Targeted Purification of Polysomal mRNA Sequencing)
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总点击数:
1943
更新日期:
2017-03-13
服务类别:

服务详情

翻译组学主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖体,新生肽链等物质的种类与丰度,动态与动力学性质,以及它们所担负的生物学功能。编码在DNA上的信息要经过转录和翻译,最终生成蛋白质,才能执行生物学功能。翻译控制在生物抗逆、病毒侵袭、肿瘤发生与发展等宏观过程都有着紧密的联系。此外,翻译组学的研究对生化工程、合成生物学等应用科学也具有直接的指导意义。翻译组学被国际人类蛋白质组计划(HPP)列为四大支柱之一。

 

研究方法

mRNA经过转录加工为成熟的mRNA后,还需要翻译为蛋白才能发挥其功能。翻译过程中会形成核糖体-新生肽链复合物(RNC,Ribosome Nascent-chain Complex),复合物中的mRNA即为能翻译成蛋白的mRNA。翻译组测序用超速离心的方法分离出RNC并进一步分离其中的mRNA进行测序,可得到正在翻译的mRNA信息。

 

生物信息分析内容

1、数据质控

2、基因表达水平分析

3、差异基因筛选

4、GO/KEGG富集分析

5、蛋白互作网络分析

6、与转录组测序或蛋白质组数据联合分析

7、可视化结果展示

 

应用方向

1、发现和鉴定新蛋白

2、蛋白质差异表达分析

3、非编码RNA(miRNA、LncRNA、cirRNA)作用机制研究

 

技术参数

样本类型:组织或细胞。承启生物可提供RNC分离及mRNA提取。客户采集样本,需采用公司提供RNC-mRNA测序专用样本保存液。

测序策略:HiSeq PE150,推荐数据量:3G clean data

项目周期:35个工作日

 

深圳承启生物科技有限公司

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公司简介

承启生物是一家汇集世界顶尖科研成果、立足珠三角地区、辐射全球的高科技生物公司。公司拥有完全自主研发、已被学界公认的超高精度基因测序分析算法,致力于用领先业界的基因研究技术造福科研及医疗。

本公司的核心技术团队由在分子生物学、大规模测序、生物信息学、临床医学等领域的做出突出贡献的专家组成,他们在国内外具有相当的知名度和学术影响力。该团队在国际上首次建立了一系列基于大规模测序的高精度实验与应用技术,可以为科研和医疗领域的单位客户或个人客户提供方便快捷、准确详尽、高度定制化的大规模精确测序与信息分析服务。


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