测序/合成

miRNA测序服务

基本信息
服务名称:
miRNA测序服务
英文名称:
miRNASeq
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总点击数:
1068
更新日期:
2017-03-13
服务类别:

服务详情

miRNA 测序是研究特定组织在特定状态下的所有已知miRNA,分析预测新的miRNA,并对已知 miRNA 和新miRNA进行靶基因预测。通过对miRNA靶基因注释及代谢通路分析,将鉴定出的 miRNA与相应表型差异关联起来,为研究miRNA对细胞进程的作用及其生物学影响提供了有力的工具。

 

生物信息分析内容

1、数据产出统计和质量评估

2、sRNA在参考基因组上的分布

3、sRNA分类注释统计

4、碱基偏好性分析

5、基因表达水平分析

6、新转录本预测

7、差异miRNA靶基因预测

8、差异基因筛选及聚类分析

9、差异表达miRNA靶基因GO富集分析

10、差异表达miRNA靶基因Pathway富集分析

11、差异表达miRNA靶基因蛋白互作网络分析

 

技术参数

样本类型:total RNA

样本要求:总量≥3 μg,浓度≥200 ng/μL

文库类型:Small RNA文库

测序策略:HiSeq SE50,推荐数据量:≥10M reads

项目周期:35个工作日

 

结果示例

样本已知miRNA各位置碱基偏好性

 

新miRNA二级结构及reads mapping示意图

 

各个样本之间共有novel miRNA分布

 

深圳承启生物科技有限公司

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公司简介

承启生物是一家汇集世界顶尖科研成果、立足珠三角地区、辐射全球的高科技生物公司。公司拥有完全自主研发、已被学界公认的超高精度基因测序分析算法,致力于用领先业界的基因研究技术造福科研及医疗。

本公司的核心技术团队由在分子生物学、大规模测序、生物信息学、临床医学等领域的做出突出贡献的专家组成,他们在国内外具有相当的知名度和学术影响力。该团队在国际上首次建立了一系列基于大规模测序的高精度实验与应用技术,可以为科研和医疗领域的单位客户或个人客户提供方便快捷、准确详尽、高度定制化的大规模精确测序与信息分析服务。


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