分子与细胞

Label Free定量泛素化组

基本信息
服务名称:
Label Free定量泛素化组
英文名称:
Label Free quantitative ubiquitination proteomics
参考报价:
总点击数:
625
更新日期:
2016-08-03
服务类别:

服务详情

技术原理

  在蛋白质组学中广泛采用的HPLC-MS/MS技术中,多肽的质谱分析次数与其丰度具有相关性,包括:蛋白的肽段序列覆盖率(sequence coverage)、肽段匹配数 (peptide hits)、PMSS 模型(peptide match score summation)、emPAI(exponentially modified PAI)等参数模型。
结合定量蛋白组学的非标定量(Label Free)策略及泛素化修饰motif的高灵敏度富集方法,我们可以在单次实验中定量到3000个以上泛素化修饰位点。为从大规模的样本中筛选药物靶点提供了技术基础。

技术优势

不使用任何标记试剂,样品处理简单
可同时比较大量样本之间的泛素化组差异信息

实验流程

参考文献

[1] LA Kane, L Michael, AI Fogel, et al. PINK1 phosphorylates ubiquitin to activate Parkin E3 ubiquitin ligase activity.. J Cell Biol. 2014, 205(2):143-153
[2] G Xu, JS Paige, SR Jaffrey, et al. Global Analysis of Lysine Ubiquitination by Ubiquitin Remnant Immunoaffinity Profiling. Nat Biotechnol. 2010, 28(8):868-873
[3] NM Griffin, J Yu, F Long, et al. Label-free, normalized quantification of complex mass spectrometry data for proteomic analysis. Nat Biotechnol 2010, 28(1):83-89

公司简介
牟合(上海)生物科技有限公司是一家致力于通过高效组学联立分析以实现疾病精准医疗并促进转化医学研究与应用的公司。公司在坚持自主技术研发和创新的基础上,吸取和借鉴国际领先研究成果,立足于建设实体肿瘤、白血病、神经退行性疾病、传染性疾病的精准治疗技术开发和应用平台,借以实现对相关疾病的早期诊断和精准治疗。
以此为使命,借助对大规模临床样本/疾病模型进行高通量蛋白组学和基因组学的联合分析以筛选疾病标志物并深入研究致病机理和耐药机理,结合领先的表观遗传学大数据分析手段,从DNA、RNA、蛋白质及翻译后修饰系统性的筛选复杂疾病的分子标志物和靶向药物簇,实现疾病的早期诊断和精确分型以及后期的精准治疗。
公司目前初步建立了表观遗传学联合分析体系:高分辨质谱平台(ThermoQ-Exactive、ObitrapVelos)和具备自主知识产权的数据处理中心,提供蛋白质关键修饰的检测与分析,非编码RNA、DNA甲基化的数据分析。基于自主科研创新,公司下设转化医学平台,与国内医学研究中心联合进行阿兹海默综合症靶向药物筛选和非小细胞肺癌的分子标志物筛查,率先开展精准医疗(precisemedicine)的实践。

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