芯片与生物信息学

生物信息学服务

基本信息
服务名称:
生物信息学服务
英文名称:
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联系方式 QQ 3544784908
总点击数:
669
更新日期:
2016-12-19
服务类别:

服务详情

服务介绍

    高通量测序技术(High-throughput sequencing)是指一次对几十万到几百万条核酸分子进行序列测定,又称之为“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology)或“第二代测序技术”,其核心思想是边合成边测序。

服务流程
1 DNA或RNA提取
2 文库构建
3 上机测序
4 数据分析

服务列表
项目 明细 周期
转录组水平 mRNA测序 45天
小RNA测序 45天
LncRNA测序 2个月
基因组水平 外显子测序 45天
全基因组测序 45天
动植物de novo测序 根据数据量而定
微生物de novo测序 根据数据量而定
表观组水平测序 全基因组甲基化测序 根据数据量而定
ChIP-seq测序 45天
META类 宏基因组测序 45天
宏转录组测序 2个月
16S/ITS/18S rDNA等扩增子测序 45天
 
测序平台:HiSeq4000,HiSeq2500,HiSeqX和MiSeq

数据分析内容(以真核转录组测序为例)
标准数据分析
1) 对原始数据进行去除接头污染序列及低质量reads 的处理
2) 参考基因组比对
3) 进行基因表达定量分析
4) 可变剪切分析(真核)
5) 新转录本预测:新mRNA和新lncRNA预测
6) 差异表达基因分析(2个或者2个以上的样本)
7) 差异基因的表达模式聚类分析
8) 差异基因的GO功能富集分析和KEGG PATHWAY富集分析
9) 差异基因的蛋白互作网络分析
10) SNP分析
高级数据分析
lncRNA-mRNA表达关联性分析,及网络图构建;
转录调控网络分析,及网络图构建和重要TF分析;
通路交互网络分析,重要通路分析。
差异表达基因共表达分析,构建网络图
转录因子活性分析,预测最重要的转录因子;
基因共上游调控元件预测
miRNA预测,预测调控靶基因的重要miRNA
主成分分析
药物小分子预测分析(适用于人类),得到最相关的药物小分子。

说明:不同的测序方法不同的分析内容,具体请来电咨询
详情可咨询微信:15339955630  QQ:3544784908
公司简介
济南丰核医药技术有限公司旗下的生物科研及医学临床研究服务平台CellLab,拥有最专业的科研顾问团队、最全面的实验技术服务、全球实验Protocols。公司团队核心成员由上海交通大学,香港大学,美国贝勒医学院,华东师范大学的高学历人才组成,总公司为上海丰核信息科技有限公司。公司凭借卓越的技术优势和顶级的顾问团队,致力于为客户提供专业的“一站式”科研学术服务。目前,CellLab主要提供生物科研及医学临床研究服务,包括多领域的实验技术服务、实验设计咨询、创新性评估、结果讨论和数据统计分析等服务。

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