小RNA测序(miRNA + piRNA + siRNA)
Small RNA是一类长度为18-30 nt,具有调控功能的非编码小RNA的总称。常见的small RNA主要包括:microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA广泛参与包括细胞生长、分化、凋亡在内的几乎所有生理过程,并与包括癌症在内的各种人类疾病相关。
云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA,为研究small RNA的功能和调控机制,或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。此外,云序生物还提供仅针对miRNA的测序服务,有效富集miRNA,在相同成本下提高了miRNA有效数据量和测序深度。
技术优势
数据分析
基本分析 |
高级分析 |
1. 数据过滤和接头序列去除 |
CS-MIR-001. miRNA靶基因预测 |
2. 序列匹配与数据统计 |
CS-MIR-002. miRNA靶基因的GO与信号通路分析 |
3. 已知小RNA(miRNA/siRNA/piRNA)识别,注释和统计 |
CS-MIR-003. miRNA-靶基因GO网络分析 |
4. 小RNA表达量计算 |
CS-MIR-004. miRNA-靶基因信号通路网络分析 |
5. 差异小RNA筛选 |
CS-MIR-005. miRNA上游转录因子分析 |
6. 小RNA表达聚类分析 |
CS-MIR-006. 新miRNA预测 |
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CS-MIR-007. miRNA分子标志物筛选 |
数据展示
云序服务内容
1. 测序服务
转录组 |
表观遗传组 |
基因组 |
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真核生物 |
原核生物 |
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上海云序生物科技有限公司于2015年成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等核心技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的创新技术企业。
云序生物聚焦科研前沿领域,是国内率先开展RNA修饰,转录组及eccDNA研究的创新性企业,提供各类RNA修饰,各类RNA分子(mRNA及非编码RNA),各类测序技术(IP类,单碱基类)及eccDNA系统性解决方案。云序作为国内表观修饰&转录组领域的领军者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系,合作单位包括超过300家科研院所和高校、200余家医院等,目前已成功完成人、动植物、原核生物等在内的数百个物种;组织、细胞、血清、血浆、胎盘、视网膜,房水等不同种类型,累计上万个样本的实验及数据分析服务,参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇,影响因子累积10000+。
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