测序/合成

细菌小RNA测序

基本信息
服务名称:
细菌小RNA测序
英文名称:
参考报价:
总点击数:
977
更新日期:
2021-08-19
服务类别:

服务详情
细菌小RNA(sRNA)是一类长度在50~300 nt的调控RNA, 与细菌生长、代谢、应激反应、致病性密切相关。细菌sRNA多通过与靶mRNA配对, 在转录后水平影响目标mRNA翻译或稳定性,影响细胞的多种生理功能。云序生物为客户提供一站式细菌小RNA测序服务,能够帮助客户识别新的细菌小RNA,解析细菌小RNA表达谱,预测细菌小RNA的靶基因,促进其功能和机制研究。
 
云序特色
  • 适用的细菌种类全面:云序生物拥有市面上最全的去rRNA试剂盒,能够去除各类细菌样品中的rRNA,高效地检测小RNA分子
  • 特异性富集小RNA特异性富集50-300 nt的小RNA片段,sRNA有效数据比例高
  • 链特异性检测:链特异性建库方案,可以准确检测反义sRNA
  • 专业的生物信息学分析:强大的生物信息学团队,满足客户的各类深入数据分析需求
 
数据分析
基本分析 高级分析
1.  原始数据整理,过滤和质量评估 CS-BSR-001.  sRNA靶基因预测
2.  序列匹配与数据统计 CS-BSR-002.  sRNA靶基因的GO与信号通路分析
3.  sRNA识别和注释 CS-BSR-003.  sRNA-靶基因相互作用网络
4.  sRNA表达量计算  
5.  差异sRNA筛选  
6.  sRNA表达聚类分析  
 
数据展示
上图:sRNA分类统计

云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组 表观遗传组 基因组
真核生物 原核生物
miRNA测序 细菌sRNA测序 (h)MeDIP测序 目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) 原核生物mRNA测序 RRBS测序 外显子组测序
lncRNA测序 宏转录组测序 全基因组甲基化测序 人类基因组重测序
环状RNA测序 原核生物转录组测序 ChIP测序 16S rDNA测序
mRNA测序 原核De novo转录组测序 RNA pull down 宏基因组测序
降解组测序   RIP测序  
转录组测序   RNA甲基化测序  
De novo转录组测序      
       
 
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 实时定量PCR服务
转录组 表观遗传组 基因组 联合分析
环状RNA分析 DNA甲基化分析 基因组分析 circRNA-miRNA 功能分型PCR芯片
lncRNA分析 ChIP测序分析 微生物菌落分析 LncRNA-mRNA 环状RNA实时定量PCR
mRNA分析   宏基因组分析 LncRNA-miRNA-mRNA LncRNA实时定量PCR
microRNA分析       miRNA实时定量PCR
        mRNA实时定量PCR
  
 
公司简介

上海云序生物科技有限公司于2015年成立,坐落于上海漕河泾新兴技术开发区,专注于表观修饰以及转录组领域,依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等核心技术,集科研服务、医学检测、产品研发于一体的创新技术企业。
云序生物聚焦科研前沿领域,是国内率先开展RNA修饰,转录组及eccDNA研究的创新性企业,提供各类RNA修饰,各类RNA分子(mRNA及非编码RNA),各类测序技术(IP类,单碱基类)及eccDNA系统性解决方案。云序作为国内表观修饰&转录组领域的领军者,拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队,不仅可以提供标准化的生物信息分析,还提供个性化的深度数据挖掘,与众多学术机构建立了合作关系,合作单位包括超过300家科研院所和高校、200余家医院等,目前已成功完成人、动植物、原核生物等在内的数百个物种;组织、细胞、血清、血浆、胎盘、视网膜,房水等不同种类型,累计上万个样本的实验及数据分析服务,参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇,影响因子累积10000+。
 


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