m1A RNA甲基化测序
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m1A RNA甲基化是一类新发现的RNA甲基化，即RNA分子腺嘌呤第1位氮原子上的甲基化修饰（N1-methyladenosine，m1A）。研究表明，m1A是真核生物tRNA和rRNA丰度很高的一种转录后修饰，近期研究也表明m1A修饰可调控mRNA翻译。m1A修饰作为一类新型RNA甲基化，其功能和机制都亟待挖掘。
与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，首先需要用LC-MS/MS对m1A甲基化水平定量。抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。此外，利用m1A会导致错配的特性，对抗体富集下来的片段用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1A甲基化修饰位点单碱基分辨率的鉴定。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将m1A RNA甲基化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，不仅计算出样本中m1A甲基化程度，同时还可找到m1A甲基化修饰的具体位点信息。
1. 测序服务
2. 生信服务 & PCR技术服务
与m6A RNA检测方式一致，针对m1A修饰也采用MeRIP-seq技术，首先需要用LC-MS/MS对m1A甲基化水平定量。抗体富集的技术原理如下：将m1A RNA甲基化特异性抗体与被随机打断的RNA片段进行共孵育，抓取有甲基化修饰的片段进行测序；同时需要平行测序一个对照（Input）样本，对照样本为未进行IP反应的RAN片段，对照样本用于消除非特异性抓取甲基化片段的背景。此外，利用m1A会导致错配的特性，对抗体富集下来的片段用去甲基化酶AlkB来实现m1A去甲基化，对比(-)去甲基化酶和(+)去甲基化酶的结果，捕捉碱基突变的信号，来实现m1A甲基化修饰位点单碱基分辨率的鉴定。对比免疫共沉淀IP样本和Input样本中的序列片段，将m1A RNA甲基化修饰位点定位到转录组上，并根据RNA-seq数据，不仅计算出样本中m1A甲基化程度，同时还可找到m1A甲基化修饰的具体位点信息。
图注：云序生物（m1A）RNA甲基化测序实验流程
云序生物 （m1A）RNA甲基化测序产品
云序优势
技术优势：
可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰
特异性高：
m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体，可特异性富集m1A修饰片段
一站式服务：
客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA，云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程
专业的生物信息学分析：
云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求
云序生物技术服务列表云序优势
技术优势：
可单碱基分辨率检测m1A甲基化修饰
特异性高：
m1A RNA-seq采用商业化m1A抗体，可特异性富集m1A修饰片段
一站式服务：
客户只需提供细胞、组织、体液或总RNA，云序生物为您完成从m1A RNA-seq富集、文库制备、上机测序到数据分析的整套服务流程
专业的生物信息学分析：
云序生物具有强大的生物信息学团队，能够满足客户的各类深入数据分析要求
1. 测序服务
2. 生信服务 & PCR技术服务
| 生信服务 | 实时定量PCR服务 | |||
| 转录组 | 表观遗传组 | 基因组 | 联合分析 | |
| 环状RNA分析 | DNA甲基化分析 | 基因组分析 | circRNA-miRNA | 功能分型PCR芯片 |
| lncRNA分析 | ChIP测序分析 | 微生物菌落分析 | LncRNA-mRNA | 环状RNA实时定量PCR |
| mRNA分析 | 宏基因组分析 | LncRNA-miRNA-mRNA | LncRNA实时定量PCR | |
| microRNA分析 | miRNA实时定量PCR | |||
| mRNA实时定量PCR | ||||
公司简介
上海云序生物科技有限公司于2015年成立，坐落于上海漕河泾新兴技术开发区，专注于表观修饰以及转录组领域，依托于高通量测序、定量PCR、质谱技术和生物信息学等核心技术，集科研服务、医学检测、产品研发于一体的创新技术企业。
云序生物聚焦科研前沿领域，是国内率先开展RNA修饰，转录组及eccDNA研究的创新性企业，提供各类RNA修饰，各类RNA分子（mRNA及非编码RNA），各类测序技术（IP类，单碱基类）及eccDNA系统性解决方案。云序作为国内表观修饰&转录组领域的领军者，拥有一支具有国际水准的生物信息分析团队，不仅可以提供标准化的生物信息分析，还提供个性化的深度数据挖掘，与众多学术机构建立了合作关系，合作单位包括超过300家科研院所和高校、200余家医院等，目前已成功完成人、动植物、原核生物等在内的数百个物种；组织、细胞、血清、血浆、胎盘、视网膜，房水等不同种类型，累计上万个样本的实验及数据分析服务，参与的研究成果在各大国际顶级期刊发表数百篇，影响因子累积10000+。
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