细胞系鉴定与STR的关系

STR（Short TandemRepeat，短串联重复序列）基因分型已被ICLAC、ATCC等权威机构作为金标准应用于细胞鉴定 。

STR基因位点由长度为3～7个碱基对的短串连重复序列组成， 这些重复序列广泛存在于人类基因组中，可作为高度多态性标记，被称为细胞的DNA指纹。STR 基因座位上的等位基因可通过扩增区域内重复序列的拷贝数的不同来区分，在毛细管电泳分离之后可通过荧光检测来识别。随后通过一定的计算方法，即可根据所得的STR分型结果与细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。

为什么要做细胞鉴定

细胞株（Cell lines）作为科研工作者常用的工具，主要用于生物医学研究的体外实验（In vitro）研究。截止目前，被ATCC及DSMZ官方数据库收录的商用细胞株约为4000种左右。近年来，随着细胞株的广泛应用，细胞株被错误鉴定和交叉污染问题显得尤为突出。为了确保实验结果的可重复性，NIH和ATCC近期对此发出呼吁，要求研究者对细胞株进行鉴定，已明确所使用细胞的身份。多种主流杂志也纷纷要求作者在投稿时提交细胞株鉴定（Cell Line Authentication）报告，有些杂志甚至要求作者提供实验前、实验中和实验后等不同阶段的细胞株鉴定报告。

本是篇Cancer Res，变成Int J Cancer，血泪教训。某985高校的硕博连读生，实验顺风顺水，按导师的设计要求完成，结果还不错，基本验证了最初的假设。导师说发个Cancer Res问题不大，投稿Cancer Res，审稿后意见返回，同时两个reviewer均提出了要对所用细胞进行细胞株鉴定（Cell Line Authentication）的要求。实验中三株肝癌细胞：HCC827、HepG2和Hep3B，都是学姐们传下来的。于是补细胞鉴定实验，鉴定结果显示HCC827和Hep3B都没问题，但HepG2竟然是Hela。只能向Cancer Res编辑部写信，说明由于细胞原因，决定撤稿，改投Int J Cance

开始要求细胞STR鉴定的期刊：

Nature; BioTechniques;  Cancer Research;  Cancer Discovery; Clinical Cancer Research; MolecularCancer Research; CancerPrevention Research; InternationalJournal of Cancer; MolecularCancer Therapeutics; CellBiochemistry and Biophysics;CancerEpidemiology, Biomarkers & Prevention;In VitroCellular & Developmental Biology – Animal;。..............

何时需做细胞STR 鉴定？

1、发表文章或申请课题经费前；

2、使用细胞进行临床治疗（试验）前；

3、准备冻存保种或已冻存多年的细胞；

4、一个涉及到细胞试验项目开始/结束时；

5、新得到的细胞或实验室培养5 代以上的细胞；

6、细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大；

7、异体细胞移植后嵌合情况检查。

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