测序/合成

甲基化DNA免疫共沉淀测序服务

基本信息
服务名称:
甲基化DNA免疫共沉淀测序服务
英文名称:
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805
更新日期:
2019-01-18
服务类别:

服务详情
  þ 甲基化DNA免疫共沉淀测序

MeDIP-Seq(Methylated DNA Immunoprecipitation Sequencing),即甲基化DNA 免疫共沉淀测序。先用5'-甲基胞嘧啶抗体富集胞嘧啶甲基化的基因组片断,然后对富集的片段进行高通量测序。该方法检测范围覆盖全基因组,所需测序数据量较少,但不能在单碱基分辨率水平上检测DNA胞嘧啶甲基化状态。

MeDIP-Seq实验路线

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MeDIP-Seq技术路线

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MeDIP-Seq样品要求(基因组DNA)

 ²  样品纯度:OD 260/280值应在1.8~2.0 之间;RNA 应去除干净。

²  样品浓度:最低浓度不低于50ng/ul。

²  样品总量:每个样品总量不少于10ug。

²  样品溶剂:溶解在H20或TE (pH 8.0)中。

²  样品运输:DNA低温运输(-20℃);且在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。
MeDIP-Seq数据分析展示

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图 差异甲基化区段分染色体注释。红色代表高甲基化,蓝色代表低甲基化。适合样本较少,用于整体展示差异甲基化区段在染色体上的分布。

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图 甲基化区域全基因组展示。最外面一圈代表染色体编号,由外向里逐层代表不同样本,用于展示样本的全基因组甲基化状态。

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图 甲基化与表达谱关联分析。把有差异的基因分别在纵坐标上显示表达的差异,在横坐标上显示甲基化的差异。适合在整体上展示甲基化与表达的负相关性。

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图 基因甲基化状态与表达相关性分析。把相同的基因排在同一行上,热图展示各个基因的甲基化修饰与表达的水平及相关性。适用于对关键基因的展示。

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图 用于展示甲基化与表达的相互作用及调控的相关性。其中高表达的基因为红色,低表达基因为绿色;高甲基化基因为正三角形,低甲基化基因为倒三角形。

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 图 甲基化程度在同不基因结构的均一化分布图。纵坐标代表甲基化程度,横坐标代表基因的不同位置。

公司简介

深圳中科普瑞基因科技有限公司,由基因科技领域的老兵组成的新军。企业创始人与核心骨干团队均从事该行业15年以上,目前着力布局基因检测的临床应用开发与科研技术服务平台。

中科普瑞下设全资子公司上海鲸舟基因科技有限公司/上海鲸舟医学检验所;立足新一代测序及其衍生技术,以医学生物信息学为核心,以各联合创始人在生物技术领域十余年工作和技术积累为资源依托,提供覆盖肿瘤等重大疾病风险评估,早期筛查,分子病理诊断,用药指导和预后预测,甲基化研究和应用、新型病原微生物感染和耐药的基因组检测等符合临床需求的解决方案,同时通过资本的纽带连接,打通上下游产业链,为精准医疗打造全方位医学诊断和服务平台,公司的中长期发展策略为医学大数据挖掘和人工智能的临床辅助诊断应用,公司的愿景是为每一个病患打造精准医疗路线图,为每一个健康人描绘基因风险预测全景,携带你的基因去远行!

公司以深圳及上海两地实验室为依托,目前已诚意推出两大品牌产品:分别为面向大众健康服务的“轻基因LightGenes”及针对临床诊疗服务的“普瑞昂科PrecisionOnco”,向国内外生物医学领域提供肿瘤等疾病用药指导及预后预测基因检测、重大疾病遗传风险评估、及符合临床需求的解决方案。


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