芯片与生物信息学

10X Genomics单细胞多组学测序

基本信息
服务名称:
10X Genomics单细胞多组学测序
英文名称:
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总点击数:
413
更新日期:
2024-03-22
服务类别:

服务详情
随着单细胞测序技术在生命科学研究领域的广泛应用,单细胞多组学技术应运而生,并且已公开发表了多种检测策略。2019年底,单细胞多组学(Single-cell multimodal omics)被 Nature Method 评为年度技术。 10x Genomics多组学解决方案,能够在多个维度上对单个细胞进行分析,包括基因表达、V(D)J序列多态性、细胞表面蛋白/抗原特异性和染色质可接近性。单细胞多组学技术可在同一细胞中捕获分析两种以上组学信息,包括转录组、基因组、表观基因组以及蛋白组等。该技术突破了以往单细胞检测的单一性,可更全面、多角度地整合分析细胞特征,为系统观察细胞异质性、 各类生物学特性及机制、研究细胞间互作以及鉴定新的细胞亚型提供的优势。


技术原理
  • Chromium系统可在十几分钟之内将样本封装到数百至数万个微反应体系,每个微反应体系中含有可唯一识别的编码DNA用于后续数据拆分及分析;
  • 每个凝胶珠(Gel Bead),注入数百万独特的寡核苷酸序列,与样品混合,样品可以是单个细胞,使用特征编码技术(Feature Barcoding Technology)标记的细胞,用转座酶处理的细胞核;
  • 凝胶珠和样品被油-表面活性剂溶液包裹,形成GEMs,其作为单独的反应囊泡,随后凝胶珠溶解并且样品被编码DNA所标记;
  • 将每个液滴中含有10x barcode信息的产物混合,构建标准测序文库,待测序后,根据10x barcode序列进行单细胞核数据拆分,并利用10x Genomics提供的可特异性解析10x barcode的分析软件进行数据分析及可视化展示。

技术优势
▶ 细胞通量高:一次可以同时做8个样本,细胞通量高达80000个细胞。
▶ 捕获率高:细胞捕获率最高可达65%。
▶ 短时高效:十几分钟内可完成上万个细胞封装,一天内获得测序文库。
▶ 双细胞发生率低:多细胞率低于0.9%/1000cells。
▶ 针对V(D)J分析,可检出单个细胞的配对的TCR/BCR双链V(D)J全长序列。
▶ 针对ATAC分析,线粒体污染率低于2%。
▶ 可进行单细胞转录组,免疫组,蛋白组,表观组多组学研究。

应用领域


大规模细胞图谱构建

细胞亚群细化&稀有细胞类型鉴定

干细胞发育及分化研究

免疫细胞分化

肿瘤方向研究

植物根部分生组织不同细胞类型鉴定


 
公司简介

北京果壳生物科技有限公司, 专注多组学与分子检测技术的研究和应用。公司成立于2017年,创始团队深耕基因检测领域,历任著名科研机构和上市公司骨干岗位。
公司在北京设有分子研发中心,占地面积约1500㎡,搭载Illumina iScan、NovaSeq 6000、10x Genomics、MassARRAY、KASP等中、高通量检测平台,为科研客户提供多组学研究的综合性解决方案。2020年,公司在成都建立临床医学检验所,具备临床基因扩增检验资质,占地面积约5000㎡,为西南地区较大的实验基地之一。拥有大规模基因组信息检测、数据分析能力,标准的质量控制流程,能够有效支撑临床实践过程中的检测项目实施需求。
果壳生物的基因芯片平台处于业内领先地位。公司先后自主研发ASA-CHIA芯片和GUOKE 50K芯片,广泛应用于科研队列研究和遗传病筛查领域,大大降低了分子诊断技术在终端的使用成本,目前检测能力高达10000例样本/周。
果壳生物目前已累计服务全国300余家科研院所、三甲医院,完成50万余份样本的基因检测工作,与全球近20位分子诊断领域的顶尖科学和医学专家建立深度合作,横跨基础研究、出生缺陷防控、个体化基因检测等多个领域,致力于让领先的基因组学检测技术发挥更大的应用价值。

公司联系方式:

电话:4000079358/18310710859

地址:北京市昌平区回龙观镇生命园路8号院6号楼401室

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