DNA甲基化芯片
服务详情
DNA甲基化是最早被发现的表观修饰之一，引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变，从而控制基因表达。DNA甲基化修饰参与了多个生物学过程，包括细胞分化、胚胎发育、X染色体失活、组织特异性等，与癌症、衰老、老年痴呆、糖尿病等多种复杂疾病密切相关。
Illumine 935K甲基化芯片介绍
甲基化芯片是研究DNA甲基化的一种常见手段，illumina推出新一代的InfiniumTM MethylationEPIC v2.0甲基化芯片是InfiniumﾠMethylationEPICﾠv1.0甲基化芯片的升级版本，与之前850K芯片相比，将位点增加到了935K。v2.0甲基化芯片移除了部分表现较差的探针，增加了大量的表观遗传前沿科学家或文章发表作者推荐的位点，主要包括靶向增强子、超级增强子、CTCF结合位点、CNV检测区域、通过ATAC-seq和ChIP-seq鉴定的开放染色质区域、850K甲基化芯片覆盖不足的CpG岛和常见癌症驱动突变。此外，935K甲基化芯片基因组版本更新至hg38，GenCode数据库更新到v41版本。
Illumine 935K甲基化芯片介绍
甲基化芯片是研究DNA甲基化的一种常见手段，illumina推出新一代的InfiniumTM MethylationEPIC v2.0甲基化芯片是InfiniumﾠMethylationEPICﾠv1.0甲基化芯片的升级版本，与之前850K芯片相比，将位点增加到了935K。v2.0甲基化芯片移除了部分表现较差的探针，增加了大量的表观遗传前沿科学家或文章发表作者推荐的位点，主要包括靶向增强子、超级增强子、CTCF结合位点、CNV检测区域、通过ATAC-seq和ChIP-seq鉴定的开放染色质区域、850K甲基化芯片覆盖不足的CpG岛和常见癌症驱动突变。此外，935K甲基化芯片基因组版本更新至hg38，GenCode数据库更新到v41版本。
Illumine 935K甲基化芯片特点
1、覆盖大部分Infinium MethylationEPIC v1.0位点
· CpG岛
· 在人干细胞中发现的非CpG（CHH）甲基化位点
· ENCODE开放染色质和增强子
· FANTOM5 增强子
· DNase超敏感位点
· miRNA 启动子区域
· > 85% HumanMethylation450 BeadChip content 在人干细胞中发现的非CpG（CHH）甲基化位点
2、MethylationEPIC v2.0 新增的探针位点:
· 在多种癌症的肿瘤与正常样本中发现的差异甲基化位点
· 通过ChIP-Seq在癌症和细胞系样本中鉴定的增强子和超级增强子
· 使用ATAC-Seq在原发性人类癌症中识别的可及染色质区域
· 扩大了CpG岛的覆盖范围
· 增强了外显子的覆盖范围，实现更准确的拷贝数变异（CNV）检测
· 常见的癌症驱动突变
3、官方测试数据显示，普通样本和FFPE样本之间的显示出较高的技术重复性（高达98%），说明测序获得的甲基化水平信息具有很高可信度
4、准确性高
· 935K芯片具有高重现性、兼容性以及与测序数据的相关性
实验流程
样本要求： DNA≥0.5 μg ，浓度≥50ng/μl； 物种： 人
公司简介
上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成，经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”，是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一，是全国生物样本标准化技术委员会（TC559）、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会（BBCMBA）与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。
通过二十余年的建设和发展，公司（中心）确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务，公司（中心）具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。
通过二十余年的建设和发展，公司（中心）确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务，公司（中心）具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。
售后服务
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