中通量单细胞转录组测序
1.模板起始量低:少量细胞、低输入量的RNA;
2.转录本覆盖度高:测序结果获得全长转录本信息,无3’和5’偏好性,产物完整度高;
3.检测灵敏度高:增加了低表达基因的检出量,帮助发现新的细胞亚群;
4.探索转录调控机制:用于检测可变剪切,在转录本层面进行SNP和突变分析,助力新的生物标志物鉴定以及新疗法的开发。
应用方向
绘制高分辨率的表达图谱:
将中通量和高通量单细胞测序平台结合,实现了对细胞的更高精准度的转录本覆盖,得到高分辨率的单细胞表达图谱,可以帮助发现新的细胞亚群。
早期胚胎发育:胚胎发育早期的细胞群体数量极其有限,中通量单细胞测序技术可以借助有限的细胞分析胚胎发育过程中的不同阶段的基因表达的差异,构建发育谱系。
单细胞可变剪切助力发病机制解析:对单细胞全长转录组进行可变剪切分析,对比疾病组与正常组或不同进展时期的单细胞可变剪切,多维度解析疾病发生进展机制。
肿瘤恶化机制研究:在肿瘤发展的过程中,对恶化前后的肿瘤细胞进行中通量单细胞测序,鉴定肿瘤异质性细胞群,挖掘新的生物标志物;此外可获得两者之间可变剪切的区别,异常可变剪切发生的基因集可能在肿瘤发展中起着关键作用。
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南京市江北新区药谷大道11号加速器二期6栋4-5层
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