单细胞转录组二代+三代测序
在单细胞二代测序的基础上,新格元推出单细胞转录组二代+三代测序方案。新增全长检测的三代测序,分析内容包括SNP/CNV、基因可变剪切、TCR/BCR全长检测、转录本isoform等。能够在单细胞水平上研究关键基因的转录本并发现新的转录本或关键基因的新的可变剪切类型,在遗传发育、肿瘤发生等方向有着重要应用。
新格元单细胞转录组二代+三代解决方案,利用GEXSCOPE®平台对单细胞mRNA捕获后进行反转录生成cDNA,利用同一份cDNA分成两部分,分别构建二代测序文库和三代测序文库,流程优化简单,二、三代单细胞优势互补,大幅降低整体实验成本,为单细胞全长转录组测序提供了一站式解决方案。并且在数据分析上相较于单独的单细胞二代或三代测序,单细胞二代+三代能够得到更加精细的细胞聚类和细胞注释。三代测序的超长读长,可获得mRNA全长序列及结构信息。单细胞转录组二代+三代测序的潜在应用范围广泛,目前已成功应用于识别细胞周期、肿瘤细胞异质性研究、鉴定罕见细胞类型、免疫细胞分型、干细胞分型、疾病分型等领域。
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